lammps npt设置非周期性边界

要设置非周期性边界条件，需要在LAMMPS输入文件中使用"boundary"命令来指定边界条件。在使用NPT（等温等压）集合平衡时，需要使用fix npt命令来设置温度和压强的控制参数。下面是一个设置非周期性边界条件和NPT集合平衡的示例输入文件：

# LAMMPS input script with non-periodic boundary condition and NPT ensemble

# Initialize simulation box and atoms
units           lj
atom_style      atomic
dimension       3
boundary        p p f       # set non-periodic boundary condition in z-direction

lattice         fcc 0.8442
region          box block 0 10 0 10 -5 5
create_box      1 box
create_atoms    1 box
mass            1 1.0

# Define potentials and interactions
pair_style      lj/cut 2.5
pair_coeff      1 1 1.0 1.0 2.5

# Define NPT ensemble parameters
compute         temp all temp
compute         press all pressure temp
fix             1 all npt temp 1.0 1.0 10.0 drag 1.0

# Run simulation
thermo_style    custom step temp press
thermo          100
timestep        0.005
run             10000

在上面的输入文件中，boundary命令设置了非周期性边界条件，其中"f"表示自由边界，表示在该方向上没有周期性。fix npt命令设置了温度、压强和时间步长等参数，并将系统的温度和压强控制在指定的值附近。运行simulation时，LAMMPS会输出温度和压强的变化情况，可以通过这些数据来检查系统是否达到了平衡状态。