对鸢尾花数据集(iris.arff.csv)实现PCA操作,数据读取及处理,特征归一化,计算协方差矩阵,奇异值分解,Ureduce = U(:, 1:k),z = Ureduceʼ * x,降至2维并绘图
时间: 2024-03-02 11:54:03 浏览: 101
好的,我们可以使用 Python 对 iris 数据集进行 PCA 操作。首先,我们需要导入所需的库,包括 pandas、numpy 和 matplotlib。
```python
import pandas as pd
import numpy as np
import matplotlib.pyplot as plt
```
接下来,我们可以使用 pandas 库读取 iris.arff.csv 文件,并将其转换为 pandas 数据框。然后,我们可以将数据框中的特征列提取出来,并将其转换为 NumPy 数组以供后续处理。
```python
df = pd.read_csv('iris.arff.csv')
features = df.iloc[:, :-1].values
```
接下来,我们需要对特征进行归一化处理,以确保它们都位于相同的尺度上。我们可以使用 sklearn 的 StandardScaler 类来标准化数据。
```python
from sklearn.preprocessing import StandardScaler
scaler = StandardScaler()
features = scaler.fit_transform(features)
```
然后,我们需要计算特征的协方差矩阵。我们可以使用 NumPy 中的 cov() 函数来计算协方差矩阵。
```python
covariance_matrix = np.cov(features.T)
```
接下来,我们需要对协方差矩阵进行奇异值分解(SVD)。我们可以使用 NumPy 中的 svd() 函数来进行奇异值分解。然后,我们可以提取前 k 个奇异值和对应的左奇异向量,以构建 Ureduce 矩阵。
```python
k = 2
U, S, V = np.linalg.svd(covariance_matrix)
Ureduce = U[:, :k]
```
然后,我们可以使用 Ureduce 矩阵将特征降至 k 维,并生成新的特征矩阵。
```python
reduced_features = np.dot(features, Ureduce)
```
最后,我们可以使用 matplotlib 库绘制结果散点图。
```python
plt.scatter(reduced_features[:,0], reduced_features[:,1])
plt.show()
```
完整的代码:
```python
import pandas as pd
import numpy as np
import matplotlib.pyplot as plt
from sklearn.preprocessing import StandardScaler
df = pd.read_csv('iris.arff.csv')
features = df.iloc[:, :-1].values
scaler = StandardScaler()
features = scaler.fit_transform(features)
covariance_matrix = np.cov(features.T)
k = 2
U, S, V = np.linalg.svd(covariance_matrix)
Ureduce = U[:, :k]
reduced_features = np.dot(features, Ureduce)
plt.scatter(reduced_features[:,0], reduced_features[:,1])
plt.show()
```
运行代码,你将得到一个 2 维散点图,表示降维后的 iris 数据集。
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