id和碱基在同一行，同时每个碱基占一列

如果你的fasta文件中id和碱基在同一行，同时每个碱基占一列，那么你需要使用另外一种读取fasta文件的方法。你可以使用下面的代码来读取fasta文件并将其格式化为一个新的fasta文件输出：

# 打开fasta文件
with open('your_fasta_file.fasta', 'r') as f:
    # 读取所有行
    lines = f.readlines()

# 初始化变量
fasta = []
current_id = ''
current_seq = ''

# 循环遍历所有行
for line in lines:
    # 如果是一个新的序列的id行
    if line.startswith('>'):
        # 如果之前已经读取了一个序列的id和序列
        if current_id != '':
            # 将当前的id和序列合并到fasta列表中
            fasta.append(f'>{current_id}\n{current_seq}')
            # 重置当前id和序列
            current_id = ''
            current_seq = ''
        # 获取新的序列的id
        current_id = line.strip()[1:]
    # 如果是一个序列行
    else:
        # 将碱基添加到当前序列中
        current_seq += line.strip()

# 将最后一个序列添加到fasta列表中
fasta.append(f'>{current_id}\n{current_seq}')

# 将fasta文件写入到文件中
with open('output.fasta', 'w') as f:
    f.write('\n'.join(fasta))

这个代码段首先打开fasta文件并读取所有行，然后使用一个循环来遍历所有行。在循环中，如果当前行是一个新的序列的id行，那么我们将之前的序列的id和序列合并到fasta列表中，并重置当前id和序列。如果当前行是一个序列行，那么我们将碱基添加到当前序列中。最后，我们将最后一个序列添加到fasta列表中，并将这些fasta格式的条目写入到一个新的文件中。