shap.summary_plot(shap_values, X_test, show=False)
时间: 2024-06-05 11:09:41 浏览: 297
这是一个使用 SHAP(SHapley Additive exPlanations)库进行特征重要性分析的代码片段。SHAP是一种模型解释技术,它可以帮助我们理解模型的预测结果是如何由输入特征贡献产生的。该代码生成了一个SHAP摘要图,用于显示每个特征对模型输出的贡献程度。其中,shap_values是通过SHAP库计算得到的每个测试样本的SHAP值,X_test是测试数据集,show=False表示不在屏幕上显示该图。
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import matplotlib.pyplot as plt import matplotlib shap.summary_plot(shap_values[0],X_test,plot_type='bar',show = False) plt.rcParams['font.family'] = 'Times New Roman' plt.savefig('F:\测试/shap.png',dpi=200, bbox_inches='tight') plt.show()设置字体大小
你可以使用 `plt.rcParams` 来设置字体大小,例如:
```python
import matplotlib.pyplot as plt
import matplotlib
import shap
# 绘制 SHAP 图形
shap.summary_plot(shap_values[0], X_test, plot_type='bar', show=False)
# 设置字体
plt.rcParams['font.family'] = 'Times New Roman'
plt.rcParams['font.size'] = 12
# 保存图形
plt.savefig('F:\\测试\\shap.png', dpi=200, bbox_inches='tight')
# 显示图形
plt.show()
```
其中,`plt.rcParams['font.family']` 表示设置字体为 Times New Roman,`plt.rcParams['font.size']` 表示设置字体大小为 12。注意,Windows 系统下路径分隔符应该使用反斜杠 `\` 转义。
写一个详细一点的SHAP对机器学习模型中变量对预测值的SHAP代码
在Python中,使用SHAP库来解释机器学习模型中的变量对预测值的影响通常涉及以下几个步骤:
首先,确保已经安装了`shap`库,如果没有,可以通过pip安装:
```bash
pip install shap
```
接下来,假设你有一个训练好的模型(例如,scikit-learn的线性回归或决策树,或者是一个黑盒深度学习模型,通过`sklearn.model_selection.cross_val_score`评估过性能),以及对应的测试数据集`X_test`和`y_test`:
1. **加载所需库并初始化SHAP Explainer**
```python
import numpy as np
import pandas as pd
from sklearn.linear_model import LinearRegression
import shap
# 假设你已经有了一个已训练好的模型model
# model = LinearRegression() 或其他模型实例
explainer = shap.KernelExplainer(model.predict, X_test[:100].values) # 使用部分数据作为解释器的基础
```
2. **计算SHAP值**
对于线性模型,可以直接使用`explainer.shap_values(X_test)`;对于非线性模型,需要选择合适的SHAP方法,如`KernelExplainer`(适用于复杂函数):
```python
if isinstance(model, LinearRegression):
shap_values = explainer.shap_values(X_test)
else:
shap_values = explainer.shap_values(X_test)
```
3. **可视化SHAP值**
使用`shap.summary_plot`生成全局和单个样本的SHAP图,以便观察特征的重要性及分布:
```python
shap.summary_plot(shap_values, X_test, feature_names=X_test.columns, plot_type="bar")
# 或者针对单个样本的SHAP值
single_explanation = shap.force_plot(explainer.expected_value, shap_values[0], X_test.iloc[0])
plt.show()
```
4. **获取每个特征对预测值的贡献**
可以通过索引来访问每个特征的SHAP值,例如:
```python
feature_importance = pd.DataFrame({"feature": X_test.columns, "shap_value": shap_values[0, :]})
feature_importance.sort_values("shap_value", ascending=False, inplace=True)
print(feature_importance)
```
5. **检查重要性与实际模型预测的关系**
检查SHAP值是否符合预期,比如对于线性模型,正系数对应正值,负系数对应负值。
这就是一个基本的SHAP应用示例。记住,这个过程可以根据你的模型和数据进行调整。对于更复杂的模型,可能需要进行更多的参数设置,比如采样次数、解释器类型等。
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