用ucsc:在mouse mm10基因组中,以NCBI RefSeq基因注释为准,基因Zc3h18包括几个转录本?在第几个外显子上存在exon skipping的选择性剪接现象?,叙述操作步骤
时间: 2024-06-09 22:07:46 浏览: 325
在UCSC Genome Browser中,按照以下步骤进行操作:
1. 打开UCSC Genome Browser网站:https://genome.ucsc.edu/
2. 点击页面左上方的"Genomes",选择"Mouse (mm10)"作为基因组。
3. 点击页面左侧的"Tools",选择"Table Browser"。
4. 在"Table"选项卡中,选择"NCBI RefSeq"作为数据集,并选择"refGene"作为表格。
5. 在"Region"选项卡中,输入"Zc3h18"作为基因名,并选择"gene"作为表格。
6. 在"Output"选项卡中,选择"exons"作为输出项,并勾选"exonStarts"和"exonEnds"。
7. 点击"get output"按钮,将获得Zc3h18基因的所有转录本及其外显子信息。
8. 找到Zc3h18基因的所有转录本,并查看它们的外显子信息。
9. 找到存在exon skipping的选择性剪接现象的外显子,并记录它在基因的第几个外显子上。
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