CGGA临床数据各列名的意思
时间: 2023-06-12 11:02:34 浏览: 212
CGGA是中国脑胶质瘤基因组图谱项目的简称,该项目收集了大量脑胶质瘤患者的临床和基因组数据。该数据集中的各列名含义如下:
1. `CGGA_ID`:患者编号
2. `sample_type`:样本类型,包括原发肿瘤、复发肿瘤、正常对照等
3. `OS`:总生存期(Overall Survival),指从诊断日期到患者死亡或最后随访日期的时间长度
4. `PFS`:无进展生存期(Progression-Free Survival),指从诊断日期到疾病进展或最后随访日期的时间长度
5. `gender`:患者性别
6. `age`:患者年龄
7. `grade`:肿瘤分级,根据肿瘤细胞形态、组织学特征、浸润性和坏死程度等因素划分为I至IV级
8. `MGMT_status`:MGMT(O6-methylguanine-DNA-methyltransferase)基因甲基化状态,该基因参与DNA修复,其甲基化可导致治疗效果差
9. `IDH_status`:IDH(Isocitrate Dehydrogenase)基因突变状态,该基因突变与脑胶质瘤的分子亚型和预后相关
10. `1p19q_status`:1p/19q染色体缺失状态,该染色体缺失与脑胶质瘤的预后相关
11. `tumor_location`:肿瘤位置,包括颞叶、额叶、顶叶、颅底等
12. `surgery`:手术情况,包括完全切除、部分切除、活检等
13. `radiation`:放疗情况,包括是否接受放疗、放疗剂量等
14. `chemo`:化疗情况,包括是否接受化疗、化疗方案等
15. `MGMT_expression`:MGMT基因表达水平
16. `IDH_mutant_level`:IDH突变水平,即突变与否和突变程度
17. `1p19q_codeletion`:1p/19q染色体缺失状态的编码值,0表示未缺失,1表示部分缺失,2表示完全缺失
18. `methylation`:全基因组甲基化水平
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