5折交叉验证_R语言k折交叉验证
时间: 2023-11-20 13:14:01 浏览: 98
在R语言中进行k折交叉验证可以使用`caret`包和`tidyr`包。下面是一个5折交叉验证的例子:
首先,我们需要准备数据。这里以`iris`数据集为例,将其分为训练集和测试集:
```r
library(tidyverse)
library(caret)
data(iris)
set.seed(123)
trainIndex <- createDataPartition(iris$Species, p = 0.8, list = FALSE)
trainData <- iris[trainIndex, ]
testData <- iris[-trainIndex, ]
```
然后,我们可以使用`createFolds()`函数创建5个折叠:
```r
folds <- createFolds(trainData$Species, k = 5, list = TRUE, returnTrain = TRUE)
```
接下来,我们可以使用`lapply()`函数遍历每个折叠,并对每个折叠进行模型训练和测试。这里我们使用`glm`函数拟合一个广义线性模型:
```r
models <- lapply(folds, function(fold) {
train <- trainData[fold, ]
test <- trainData[-fold, ]
glm(Species ~ ., data = train, family = "binomial")
})
```
然后,我们可以使用`predict()`函数对测试集进行预测,并计算准确率:
```r
accuracies <- sapply(models, function(model) {
predictions <- predict(model, newdata = testData, type = "response")
mean(predictions == testData$Species)
})
mean(accuracies)
```
这样就完成了一个5折交叉验证的过程。