用Python写一个可以将任意DNA单链序列的反向互补序列补写出来的程序
时间: 2023-10-02 18:07:38 浏览: 73
可以使用Python中的字符串操作和字典数据类型来编写程序,示例程序如下:
```python
def reverse_complement(dna_seq):
# 定义碱基互补配对的字典
base_complement = {'A': 'T', 'T': 'A', 'C': 'G', 'G': 'C'}
# 将序列转换为大写字母
dna_seq = dna_seq.upper()
# 反转序列并替换为互补碱基
rev_comp_seq = ''.join([base_complement[base] for base in reversed(dna_seq)])
return rev_comp_seq
```
这个函数输入一个字符串类型的DNA序列,输出该序列的反向互补序列。可以将函数保存到一个.py文件中,然后在其他程序中调用。例如:
```python
from reverse_complement import reverse_complement
dna_seq = 'ATCGTAGC'
rev_comp_seq = reverse_complement(dna_seq)
print('原始序列:', dna_seq)
print('反向互补序列:', rev_comp_seq)
```
运行该程序会输出:
```
原始序列: ATCGTAGC
反向互补序列: GCTACGAT
```
注意,在运行程序前需要将函数保存到一个名为`reverse_complement.py`的文件中,或者将函数拷贝到主程序文件中。
阅读全文