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如何解压.fastq.gz文件

时间: 2023-05-16 18:05:11 浏览: 1898

genozip：用于基因组文件（FASTQ，SAMBAM，VCF，FASTA，GVF，23andMe ...）的压缩器，比gzip压缩多达5倍，并且速度也更快

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Genozip （可在Conda ， Docker Hub和） Genozip是一种用于基因组文件的压缩器-虽然它可以压缩任何文件（即不仅是基因组文件），但它经过优化可以压缩FASTQ，SAM / BAM / CRAM，VCF / BCF，FASTA，GVF，Phylip和23andMe文件。如果它们已经使用.gz .bz2 .xz进行压缩，它甚至可以对其进行压缩（有关受支持的文件类型的完整列表，请参见'genozip --help = input'）。压缩率取决于要压缩的数据，通常，压缩.bam时，压缩率约为1.5-3倍； .fastq.gz文件（即压缩已压缩的文件），压缩率通常为2X-5X；压缩时，压缩率最高可达200倍。一个只有GT数据的未压缩的高样本数.vcf文件。注册以接收与Genozip相关的低频更新： ://tinyurl.com/genozip 压缩是无损的-

你可以使用以下命令解压 .fastq.gz 文件： ``` gzip -d file.fastq.gz ``` 或者使用以下命令： ``` gunzip file.fastq.gz ``` 这将解压缩文件并将其保存为 .fastq 文件。

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