maxent: adjust sampling radius R代码设置
时间: 2024-03-11 11:49:40 浏览: 120
Maxent:物种地理分布的最大熵建模
在 R 语言中,你可以在 `maxent` 函数中设置 `args` 参数来调整 MaxEnt 模型的参数,包括采样半径。
以下是一个示例代码:
```R
library(dismo)
# 加载数据
data <- read.csv("species.csv")
x <- data[,2:ncol(data)] # 环境变量数据
y <- data[,1] # 物种数据
# 设置 MaxEnt 参数
args <- c("-J", "mxcl", "-P", "-z", "0.5", "-t", "0.5", "-o", "output")
# 运行 MaxEnt
model <- maxent(x, y, args=args)
# 预测新的物种分布
pred <- predict(model, x)
```
在上述代码中,`args` 参数用于设置 MaxEnt 的参数。其中,`-z` 参数用于设置采样半径,这里设置为 0.5。你可以根据实际情况调整采样半径的值,并比较模型的效果。除了 `-z` 参数,还有许多其他的参数可以用来调整 MaxEnt 模型的行为,具体可以参考 MaxEnt 的文档。
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