Error in if (abs(mat[ir, ic] - mat[ic, ir]) > 1e-08) { : missing value where TRUE/FALSE needed

这个错误提示表示在 if 语句中需要一个逻辑值 (TRUE 或 FALSE)，但是得到了缺失值。最可能的原因是 mat 矩阵中存在缺失值，因此 mat[ir, ic] 或 mat[ic, ir] 中的一个或两个值是缺失值。请检查 mat 矩阵中的缺失值并进行处理，例如使用 na.omit 函数删除缺失值。另外，您也可以使用 is.na 函数检查 mat 矩阵中是否存在缺失值。

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chordDiagram(cor1, grid.col=rainbow(ncol(rt)), col=col1, transparency = 0.5, symmetric = T) Error in if (abs(mat[ir, ic] - mat[ic, ir]) > 1e-08) { : missing value where TRUE/FALSE needed

这个错误提示意味着在使用chordDiagram函数时，输入的矩阵(cor1)中包含了缺失值(missing value)，导致了if语句无法进行比较操作。你可以通过检查输入矩阵是否包含缺失值，或者使用函数如na.omit()或complete.cases()来删除缺失值。另外，你也可以检查一下col1变量的取值是否正确，以及symmetric参数是否设置正确。