写一个python程序:将latent_data随机分为10个子集,每次取1个子集作为测试集,其他九个作为训练集,进行主成分分析,并计算准确率。注:latent_data中第一列为样本名称,第一行为特征名称
时间: 2024-02-11 17:09:28 浏览: 55
好的,以下是一个基于 scikit-learn 和 pandas 的 Python 程序,可以实现您的需求:
```python
import pandas as pd
import numpy as np
from sklearn.decomposition import PCA
from sklearn.model_selection import KFold
from sklearn.neighbors import KNeighborsClassifier
# 读取数据
data = pd.read_csv('latent_data.csv', index_col=0)
# 将数据分为特征和标签
X = data.values[:, 1:] # 特征
y = data.index.values # 标签
# 定义主成分分析模型和 KNN 分类器
pca = PCA(n_components=2)
knn = KNeighborsClassifier(n_neighbors=5)
# 定义 K 折交叉验证器,将数据分为 10 个子集
kf = KFold(n_splits=10, shuffle=True)
# 定义准确率列表
accuracies = []
# 依次将每个子集作为测试集,其他九个作为训练集,进行主成分分析和 KNN 分类,并计算准确率
for train_index, test_index in kf.split(X):
X_train, X_test = X[train_index], X[test_index]
y_train, y_test = y[train_index], y[test_index]
# 对训练集进行主成分分析
pca.fit(X_train)
X_train_pca = pca.transform(X_train)
# 对测试集进行主成分分析
X_test_pca = pca.transform(X_test)
# 训练 KNN 分类器
knn.fit(X_train_pca, y_train)
# 计算准确率
accuracy = knn.score(X_test_pca, y_test)
accuracies.append(accuracy)
# 输出准确率的平均值
print('平均准确率:', np.mean(accuracies))
```
请将代码中的 `latent_data.csv` 替换为您实际的数据文件名,并确保数据文件中的第一列为样本名称,第一行为特征名称。该程序会将数据随机分为 10 个子集,并依次将每个子集作为测试集,其他九个作为训练集,进行主成分分析和 KNN 分类,并计算准确率,最后输出准确率的平均值。
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