class DTIDataset(data.Dataset): def __init__(self, list_IDs, df, max_drug_nodes=290): self.list_IDs = list_IDs self.df = df self.max_drug_nodes = max_drug_nodes self.atom_featurizer = CanonicalAtomFeaturizer() self.bond_featurizer = CanonicalBondFeaturizer(self_loop=True) self.fc = partial(smiles_to_bigraph, add_self_loop=True)是什么意思
时间: 2023-05-10 20:55:37 浏览: 55
这段代码定义了一个名为DTIDataset的类,它继承自data.Dataset。在初始化函数中,它接受三个参数:list_IDs、df和max_drug_nodes。它还定义了一个atom_featurizer和一个bond_featurizer,它们分别使用CanonicalAtomFeaturizer和CanonicalBondFeaturizer类进行初始化。最后,它定义了一个fc函数,它使用smiles_to_bigraph函数将SMILES字符串转换为图形表示,并添加了自环。
相关问题
优化这段代码class dataset(Dataset.Dataset): def __init__(self, Data, transform=None): self.Data = Data self.transform = transform def __len__(self): return len(self.Data) def __getitem__(self, idx): data = self.Data[idx] img_transformed = self.transform(data) return img_transformed
A:这段代码的性能已经不错,但有一些小的优化可能会提高其效率:
1. 使用torchvision.transforms.Compose()将所有变换组合,以避免在每个样本中重复调用Transform;
2. 在获取项目时,将数据转换为Tensor,而不是在每个Transform中进行转换。这将减少在每个Transform上进行的操作;
3. 尝试缓存已转换的数据,以避免重复调用Transform。
修改后的代码示例:
```
from torchvision import transforms
class CustomDataset(Dataset):
def __init__(self, data, transform=None):
self.data = data
self.transform = transform
# 将所有变换组合为一个Compose Transforms
if transform is not None:
self.transform = transforms.Compose(transform)
else:
self.transform = transforms.Compose([transforms.ToTensor()])
def __len__(self):
return len(self.data)
def __getitem__(self, idx):
# 缓存已转换的数据 (optional)
if idx in self.cache:
return self.cache[idx]
# 获取示例数据并转换为Tensor
img, label = self.data[idx]
img = transforms.ToTensor()(img)
# 应用变换
if self.transform is not None:
img = self.transform(img)
# 将转换后的数据缓存 (optional)
self.cache[idx] = img
return img, label
```
注意:这只是一些可能提高效率的建议,并不一定适用于所有数据集和变换。请根据您特定的应用程序进行适当的调整和测试。
class MyDate(Dataset): def __init__(self, data_name): super.__init__()
在这段代码中,定义了一个名为 `MyDate` 的类,该类继承自 `Dataset` 类,并且实现了 `__init__` 方法。`__init__` 方法接收一个参数 `data_name`,用于初始化数据集的名称。在该方法的第一行,调用了父类 `Dataset` 的构造函数,以便继承父类的属性和方法。需要注意的是,在调用父类的方法时,需要使用 `super()` 函数,而且需要将该函数与类名、方法名连用,即 `super(MyDate, self).__init__()`。