--complexity_threshold参数是什么意思

--complexity_threshold是fastp中的一个参数，用于设置复杂度阈值，用于过滤低复杂度序列。复杂度是指序列中的不同k-mer数量。如果序列的复杂度低于指定的阈值，说明序列中存在大量重复的子序列，可能是PCR扩增、低质量序列或人工污染引起的，因此可以将这些序列过滤掉。--complexity_threshold的默认值是30，表示过滤掉复杂度低于30的序列。可以通过调整该值来适应不同的数据集和应用场景。