# # 全区预测 block_size = 500 # 设置块大小 raster = path + '/bands/ccrop21.tif' output_fname = path + 'predict/RFpredict2021.tif' # 打开 TIFF 文件 raster_dataset = gdal.Open(raster, gdal.GA_ReadOnly) geo_transform = raster_dataset.GetGeoTransform() proj = raster_dataset.GetProjectionRef() # 获取 TIFF 文件的行列数和波段数 rows = raster_dataset.RasterYSize cols = raster_dataset.RasterXSize n_bands = raster_dataset.RasterCount # 创建输出文件 driver = gdal.GetDriverByName('GTiff') out_dataset = driver.Create(output_fname, cols, rows, 1, gdal.GDT_Float32) out_dataset.SetGeoTransform(geo_transform) out_dataset.SetProjection(proj) # 逐块处理数据 for i in range(0, rows, block_size): for j in range(0, cols, block_size): # 计算当前块的行列范围 i_end = min(i + block_size, rows) j_end = min(j + block_size, cols) i_size = i_end - i j_size = j_end - j # 逐块读取数据 bands_data = [] for b in range(1, n_bands + 1): band = raster_dataset.GetRasterBand(b) data = band.ReadAsArray(j, i, j_size, i_size) bands_data.append(data) # 将数据堆叠为一个三维数组 bands_data = np.dstack(bands_data) # 将数据重塑为二维数组 n_samples = i_size * j_size flat_pixels = bands_data.reshape((n_samples, n_bands)) # 预测并将结果写入输出文件 result = RFmodel.predict(flat_pixels) ypredict = result.reshape((i_size, j_size)) out_dataset.GetRasterBand(1).WriteArray(ypredict, j, i) out_dataset.FlushCache() del out_dataset
时间: 2024-03-15 08:43:30 浏览: 115
这段代码是使用随机森林模型对一个TIFF文件进行预测,并将结果写入另一个TIFF文件中。具体来说,它首先打开一个TIFF文件,并获取其行列数和波段数,然后创建一个输出TIFF文件,设置其地理变换和投影信息,并逐块读取数据。对于每个块,它先将各波段数据堆叠为一个三维数组,然后将其重塑为一个二维数组,以便于输入随机森林模型进行预测。最后,将预测结果写入输出文件中。
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import arcpy import os import pandas as pd arcpy.env.workspace = "D:/reptile/" # 设置输入地理数据库路径,根据需要替换 tif_file_path = "D:/reptile/mask_reptiles.gdb/" clip_file_path = "D:/reptile/reptile_raster_clip/" shp_file_name = "D:/reptile/mammal25/mammal25km.shp" arcpy.env.workspace = tif_file_path excel_file = "D:/reptile/reptile_threated_list.xlsx" df = pd.read_excel(excel_file) name_list = df['scientificName'].tolist() raster_names = [raster for raster in arcpy.ListRasters("*", "TIF") if raster.split(".tif")[0] in name_list] for raster in raster_names: key_name = os.path.splitext(raster)[0] + ".tif" clip_file_name = os.path.join(clip_file_path, key_name) clip_file = ExtractByMask(tif_file, shp_file_name) clip_file.save(clip_file_name) for raster in raster_names: key_name = os.path.split(raster)[0] + ".tif" clip_file_name = os.path.join(clip_file_path, key_name) clip_file = ExtractByMask(tif_file, shp_file_name) clip_file.save(clip_file_name)
看起来您想要从地理数据库中读取栅格文件,并将其根据Excel中的物种列表进行批量处理,并将其转换为矢量多边形。不过,在您提供的代码中,有一些错误和缺失,我来给您进行修正和补充。
首先,您需要导入arcpy模块,并设置工作空间(workspace)为地理数据库路径。同时,您还需要指定栅格文件夹路径(tif_file_path)和矢量裁剪文件路径(clip_file_path)。另外,您需要读取Excel文件中的物种名称列表,并将其存储为一个列表对象(name_list)。
```python
import arcpy
import os
import pandas as pd
# 设置工作空间
arcpy.env.workspace = "D:/reptile/"
# 设置栅格文件夹路径和矢量裁剪文件路径
tif_file_path = "D:/reptile/mask_reptiles.gdb/"
clip_file_path = "D:/reptile/reptile_raster_clip/"
# 读取Excel文件中的物种名称列表
excel_file = "D:/reptile/reptile_threated_list.xlsx"
df = pd.read_excel(excel_file)
name_list = df['scientificName'].tolist()
```
接下来,您需要使用arcpy.ListRasters()函数获取地理数据库中所有栅格文件的列表,并对于每一个栅格文件进行裁剪,并将裁剪结果存储到指定的文件夹中。这里需要注意的是,您需要根据栅格文件名称和物种名称进行匹配,以确保只裁剪出需要的栅格文件。
```python
# 获取地理数据库中所有栅格文件的列表
raster_names = [raster for raster in arcpy.ListRasters("*", "TIF")]
# 对于每一个栅格文件,进行裁剪,并将裁剪结果存储到指定的文件夹中
for raster in raster_names:
# 获取栅格文件名称
raster_name = os.path.splitext(raster)[0]
# 如果栅格文件名称在物种名称列表中,则进行裁剪
if raster_name in name_list:
# 设置裁剪文件名称和路径
clip_file_name = os.path.join(clip_file_path, raster_name + ".shp")
# 进行裁剪
arcpy.Clip_management(raster, "#", clip_file_name, shp_file_name, "#", "ClippingGeometry")
```
最后,您需要将裁剪出的矢量多边形进行进一步处理,例如合并、转换为栅格等操作。这里需要根据具体的需求进行选择和处理。
```python
# 对于每一个裁剪出的矢量多边形,进行进一步处理
for clip_file in arcpy.ListFeatureClasses("*", "POLYGON", clip_file_path):
# 进行合并等进一步处理
...
```
需要注意的是,在裁剪和进一步处理过程中,您需要根据具体的需求和数据格式选择合适的arcpy函数。在实现过程中建议参考arcpy官方文档和相关教程,确保代码正确运行。
% 定义输入输出路径和文件名 input_path = 'path/to/input/tif/files/'; output_path = 'path/to/output/tif/files/'; output_file_prefix = 'output_'; % 定义时间序列 start_date = datetime('2020-01-01'); end_date = datetime('2020-12-31'); date_range = start_date:hours(1):end_date; % 循环处理每个tif文件 for i = 1:46 % 读取tif文件 filename = sprintf('file_%02d.tif', i); filepath = fullfile(input_path, filename); raster = geotiffread(filepath); info = geotiffinfo(filepath); % 将栅格数据转换为时间序列 ts = timeseries(raster, date_range); % 插值为每小时一张的数据 ts_hourly = resample(ts, date_range, 'linear'); % 将时间序列转换为栅格数据 raster_hourly = reshape(ts_hourly.Data, [size(raster, 1), size(raster, 2), numel(date_range)]); % 导出为tif文件 output_filename = [output_file_prefix, filename]; output_filepath = fullfile(output_path, output_filename); geotiffwrite(output_filepath, raster_hourly, info); end里面file_%02d.tif怎么修改
如果您想修改文件名中的格式,可以根据需要修改`sprintf`函数中的格式字符串。`'%02d'`表示将数字转换为两位数,前面用0补齐。如果您希望将数字转换为其他格式,比如三位数或者不用补齐,可以修改格式字符串。以下是一些示例:
- 将数字转换为三位数,前面用0补齐:`'%03d'`
- 将数字转换为不用补齐的两位数:`'%2d'`
- 将数字转换为不用补齐的三位数:`'%3d'`
例如,如果您希望将文件名中的数字部分转换为三位数,可以将`sprintf`函数中的格式字符串修改为`'file_%03d.tif'`。
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