tomopy进行半扫描重建设置
时间: 2024-05-04 09:15:16 浏览: 8
Tomopy是一个用于X射线计算机断层扫描成像重建的Python软件包。在进行半扫描重建设置之前,需要安装Tomopy并导入相关模块。下面是进行半扫描重建设置的步骤:
1. 导入必要的模块
```python
import tomopy
import dxchange
```
2. 加载数据
```python
proj, flat, dark, theta = dxchange.read_aps_32id('data_dir', sino=(start, end))
```
其中,`data_dir`是数据所在的文件夹路径,`sino=(start, end)`指定要读取的投影数据的子集,`start`和`end`是起始和终止角度。
3. 进行半扫描重建设置
```python
recon = tomopy.recon(proj, theta, center=None, sinogram_order=False, algorithm='gridrec', filter_name='parzen', ncore=None, nchunk=None, nchunk_proj=None, padding=False, axis_order=None, out=None)
```
其中,`proj`是投影数据,`theta`是角度数据,`center`是旋转中心,`algorithm`是重建算法(例如,gridrec、art、sirt等),`filter_name`是过滤器名称,`padding`指定是否对投影数据进行填充,`out`指定输出结果的路径。
4. 保存重建结果
```python
dxchange.write_tiff(recon, 'recon_dir/recon', dtype='float32', overwrite=True)
```
其中,`recon`是重建结果,`recon_dir/recon`是输出结果的路径,`dtype`指定数据类型,`overwrite`指定是否覆盖已有的文件。