以下R代码:library(glmnet) library(ggplot2) # 生成5030的随机数据和30个变量 set.seed(1111) n <- 50 p <- 30 X <- matrix(runif(n * p), n, p) y <- rnorm(n) # 生成三组不同系数的线性模型 y = X1 + 2X2 + 3X3 + e, y = X11 + 2X22 + 3X33 + e, y = X21 + 2X22 + 3X23 + e beta1 <- c(rep(1, 3), rep(0, p - 3)) beta2 <- c(rep(0, 10), rep(1, 3), rep(0, p - 13)) beta3 <- c(rep(0, 20), rep(1, 3), rep(0, p - 23)) y1 <- X %% beta1 + rnorm(n) y2 <- X %% beta2 + rnorm(n) y3 <- X %% beta3 + rnorm(n) # 线性回归中分别计算三组的CV值 cv1 <- cv.glmnet(X, y1, alpha = 0) cv2 <- cv.glmnet(X, y2, alpha = 0) cv3 <- cv.glmnet(X, y3, alpha = 0) # 岭回归中计算三组的CV值并画图 ridge1 <- glmnet(X, y1, alpha = 0) ridge2 <- glmnet(X, y2, alpha = 0) ridge3 <- glmnet(X, y3, alpha = 0) # 分别绘制三组岭回归的图 # 绘制第一组交叉验证误差图 ggplot(data = data.frame(lambda = cv1$glmnet.fit$lambda, cvm = cv1$glmnet.fit$cvm), aes(x = log(lambda), y = cvm)) + geom_line() + scale_x_reverse() + labs(title = "Cross-validation Error Plot for First Model") # 绘制第一组预测误差图 yhat1 <- predict(ridge1, s = cv1$glmnet.fit$lambda.1se, newx = X) ggplot(data.frame(y = y, yhat = yhat1), aes(x = y, y = yhat)) + geom_abline() + geom_point() + labs(title = "Predicted vs. Actual Plot for First Model") # 绘制第二组交叉验证误差图 ggplot(data = data.frame(lambda = cv2$glmnet.fit$lambda, cvm = cv2$glmnet.fit$cvm), aes(x = log(lambda), y = cvm)) + geom_line() + scale_x_reverse() + labs(title = "Cross-validation Error Plot for Second Model") # 绘制第二组预测误差图 yhat2 <- predict(ridge2, s = cv2$glmnet.fit$lambda.1se, newx = X) ggplot(data.frame(y = y, yhat = yhat2), aes(x = y, y = yhat)) + geom_abline() + geom_point() + labs(title = "Predicted vs. Actual Plot for Second Model") # 绘制第三组交叉验证误差图 ggplot(data = data.frame(lambda = cv3$glmnet.fit$lambda, cvm = cv3$glmnet.fit$cvm), aes(x = log(lambda), y = cvm)) + geom_line() + scale_x_reverse() + labs(title = "Cross-validation Error Plot for Third Model") # 绘制第三组预测误差图 yhat3 <- predict(ridge3, s = cv3$glmnet.fit$lambda.1se, newx = X) ggplot(data.frame(y = y, yhat = yhat3), aes(x = y, y = yhat)) + geom_abline() + geom_point() + labs(title = "Predicted vs. Actual Plot for Third Model")。问题出现在第一组交叉验证误差图的代码中,具体是在 data.frame(lambda = cv1$glmnet.fit$lambda, cvm = cv1$glmnet.fit$cvm) 这一行。可以看到,cv1$glmnet.fit$cvm 的值为空。所以请对原代码进行修正
时间: 2024-04-29 12:20:10 浏览: 15
可以将第一组线性模型的 cv.glmnet() 函数中的参数 alpha 改为 1,即 cv.glmnet(X, y1, alpha = 1),因为当 alpha=0 时,glmnet() 函数使用的是岭回归,而不是lasso回归,因此没有cvm的值。当 alpha=1 时,使用的是lasso回归,即可计算出 c-v error。
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请基于以下R代码:library(glmnet) library(ggplot2) # 生成5030的随机数据和30个变量 set.seed(1111) n <- 50 p <- 30 X <- matrix(runif(n * p), n, p) y <- rnorm(n) # 生成三组不同系数的线性模型 beta1 <- c(rep(1, 3), rep(0, p - 3)) beta2 <- c(rep(0, 10), rep(1, 3), rep(0, p - 13)) beta3 <- c(rep(0, 20), rep(1, 3), rep(0, p - 23)) y1 <- X %*% beta1 + rnorm(n) y2 <- X %*% beta2 + rnorm(n) y3 <- X %*% beta3 + rnorm(n),每个线性模型组,均进行交叉验证,并以par(3,2)的规格分别画出每组的交叉验证误差图和预测误差图
以下是基于给定的R代码,每个线性模型组,均进行交叉验证,并以par(3,2)的规格分别画出每组的交叉验证误差图和预测误差图的完整R代码:
```R
library(glmnet)
library(ggplot2)
# 生成5030的随机数据和30个变量
set.seed(1111)
n <- 50
p <- 30
X <- matrix(runif(n * p), n, p)
y <- rnorm(n)
# 生成三组不同系数的线性模型
beta1 <- c(rep(1, 3), rep(0, p - 3))
beta2 <- c(rep(0, 10), rep(1, 3), rep(0, p - 13))
beta3 <- c(rep(0, 20), rep(1, 3), rep(0, p - 23))
y1 <- X %*% beta1 + rnorm(n)
y2 <- X %*% beta2 + rnorm(n)
y3 <- X %*% beta3 + rnorm(n)
# 线性回归中分别计算三组的CV值
cv1 <- cv.glmnet(X, y1, alpha = 0)
cv2 <- cv.glmnet(X, y2, alpha = 0)
cv3 <- cv.glmnet(X, y3, alpha = 0)
# 岭回归中计算三组的CV值并画图
ridge1 <- glmnet(X, y1, alpha = 0)
ridge2 <- glmnet(X, y2, alpha = 0)
ridge3 <- glmnet(X, y3, alpha = 0)
# 画图
par(mfrow = c(3, 2))
# 以交叉验证误差为纵坐标的图
plot(cv1, main = "CV Error for Model 1")
plot(cv2, main = "CV Error for Model 2")
plot(cv3, main = "CV Error for Model 3")
# 以预测误差为纵坐标的图
plot(ridge1, xvar = "lambda", main = "Prediction Error for Model 1")
plot(ridge2, xvar = "lambda", main = "Prediction Error for Model 2")
plot(ridge3, xvar = "lambda", main = "Prediction Error for Model 3")
```
基于以下R代码:library(glmnet) library(ggplot2) # 生成5030的随机数据和30个变量 set.seed(1111) n <- 50 p <- 30 X <- matrix(runif(n * p), n, p) y <- rnorm(n) # 生成三组不同系数的线性模型 beta1 <- c(rep(1, 3), rep(0, p - 3)) beta2 <- c(rep(0, 10), rep(1, 3), rep(0, p - 13)) beta3 <- c(rep(0, 20), rep(1, 3), rep(0, p - 23)) y1 <- X %% beta1 + rnorm(n) y2 <- X %% beta2 + rnorm(n) y3 <- X %*% beta3 + rnorm(n),每个线性模型组,均进行交叉验证,并以par(3,2)的规格分别画出每组在进行交叉验证时,基于不同的$\lambda$的交叉验证误差图和预测误差图
好的,以下是基于你提供的代码实现您的需求:
```
library(glmnet)
library(ggplot2)
# 生成5030的随机数据和30个变量
set.seed(1111)
n <- 50
p <- 30
X <- matrix(runif(n * p), n, p)
y <- rnorm(n)
# 生成三组不同系数的线性模型
beta1 <- c(rep(1, 3), rep(0, p - 3))
beta2 <- c(rep(0, 10), rep(1, 3), rep(0, p - 13))
beta3 <- c(rep(0, 20), rep(1, 3), rep(0, p - 23))
y1 <- X %*% beta1 + rnorm(n)
y2 <- X %*% beta2 + rnorm(n)
y3 <- X %*% beta3 + rnorm(n)
# 进行交叉验证并绘制误差图
cv1 <- cv.glmnet(X, y1)
cv2 <- cv.glmnet(X, y2)
cv3 <- cv.glmnet(X, y3)
# 绘制交叉验证误差图
par(mfrow = c(3, 2))
plot(cv1)
plot(cv2)
plot(cv3)
# 绘制预测误差图
pred1 <- predict(cv1, newx = X)
pred2 <- predict(cv2, newx = X)
pred3 <- predict(cv3, newx = X)
ggplot(data.frame(y = y1, y_pred = pred1), aes(x = y, y = y_pred)) +
geom_point() +
labs(title = "Model 1 Prediction Error Plot")
ggplot(data.frame(y = y2, y_pred = pred2), aes(x = y, y = y_pred)) +
geom_point() +
labs(title = "Model 2 Prediction Error Plot")
ggplot(data.frame(y = y3, y_pred = pred3), aes(x = y, y = y_pred)) +
geom_point() +
labs(title = "Model 3 Prediction Error Plot")
```
以上代码会生成三张交叉验证误差图和三张预测误差图,分别对应三个不同系数的线性模型。请注意,由于您没有指定交叉验证的次数和$\lambda$的范围,我在代码中使用了默认值。如果您需要更多的控制,可以参考glmnet函数的文档。