我需要生存分析gof检验的R语言代码
时间: 2023-09-06 19:14:37 浏览: 139
生信分析论文套路R语言代码
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以下是R语言中进行生存分析中的GoF检验的代码,主要使用的是经典的Log-Rank Test和Cox-Snell检验方法:
```R
# 加载所需的包
library(survival)
library(survminer)
# 导入数据
data(lung)
# 创建生存对象
surv_object <- Surv(lung$time, lung$status)
# 拟合生存曲线
fit <- survfit(surv_object ~ 1)
# 绘制生存曲线
ggsurvplot(fit)
# 执行Log-Rank Test
survdiff_object <- survdiff(surv_object ~ lung$sex)
summary(survdiff_object)
# 执行Cox-Snell检验
coxsnell_object <- coxsnell(surv_object, lung$sex)
coxsnell_object$chisq
coxsnell_object$pvalue
```
其中,我们使用了`lung`数据集进行演示,你可以替换成自己的数据集。`surv_object`是生存对象,`fit`是拟合的生存曲线。`survdiff_object`是Log-Rank Test的结果,`coxsnell_object`是Cox-Snell检验的结果。`ggsurvplot`函数用于绘制生存曲线。
希望这个R语言代码可以帮助到你。
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