怎么把txt文件转换为smi文件

要将txt文件转换为smi文件，您需要使用特定的软件。以下是将txt文件转换为smi文件的步骤：

1. 下载并安装“Subtitle Workshop”软件，该软件是一款流行的字幕编辑器，可免费下载。

2. 打开“Subtitle Workshop”软件，并选择“File”菜单中的“New Subtitle”选项。

3. 在弹出的窗口中，选择“Text Subtitle”作为文件类型，并单击“OK”按钮。

4. 在“Subtitle1”窗口中，将txt文件的内容复制并粘贴到窗口中。

5. 在“Subtitle1”窗口中，选择“File”菜单中的“Save As”选项。

6. 在弹出的窗口中，选择“SAMI Captioning”作为文件类型，并为文件命名。

7. 单击“Save”按钮，以将txt文件转换为smi文件。

完成上述步骤后，您将成功将txt文件转换为smi文件。

相关问题

pdbqt文件批量转smile

PDBQT文件是用于描述分子结构的一种格式，而SMILES则是用于描述分子结构的一种字符串表示方法。因此需要将PDBQT文件中的分子结构转换成SMILES表示方法，以便进行后续的分析和处理。

要实现PDBQT文件批量转换为SMILES，可以使用一些现有的化学软件，如Open Babel、RDKit等，这些软件都提供了PDBQT文件转换为SMILES的功能。

具体步骤如下：

1. 将需要转换的PDBQT文件保存在同一个文件夹下，记为“input”文件夹。

2. 打开终端或命令提示符，进入到Open Babel或RDKit的安装路径下的Scripts文件夹中。

3. 在终端或命令提示符中输入命令：

openbabel -ipdbqt input/*.pdbqt -osmi -O output/*.smi

或者

python convert.py -i input -o output -f pdbqt -t smi

其中“input/*.pdbqt”表示需要转换的所有PDBQT文件，“-osmi”表示转换为SMILES格式，“output/*.smi”表示输出文件夹中的输出文件。

4. 等待转换完成后，所有的PDBQT文件就被转换为SMILES格式并保存在“output”文件夹中。

需要注意的是，在进行PDBQT文件批量转换为SMILES时，可能会有一些分子结构无法正确转换或SMILES输出格式存在问题。因此在进行后续分析之前需要进行验证和检查。

需要molecule对象，现在是个文件list

你可以使用RDKit库中的函数来将文件列表转换为分子对象。以下是一个示例代码，可以将SMILES文件列表转换为分子对象列表：

from rdkit import Chem

file_list = ['file1.smi', 'file2.smi', 'file3.smi']

mol_list = []
for file in file_list:
    with open(file, 'r') as f:
        for line in f:
            line = line.strip()
            if line:
                mol = Chem.MolFromSmiles(line)
                if mol:
                    mol_list.append(mol)

在这个示例中，我们首先循环遍历文件列表中的每个文件。然后，我们打开每个文件并逐行读取SMILES字符串。我们使用RDKit中的`Chem.MolFromSmiles()`函数将每个SMILES字符串转换为分子对象，并将其添加到`mol_list`列表中。最终，`mol_list`中将包含所有文件中的分子对象。