用python写一个光谱基线校正函数

时间: 2023-08-12 08:05:01 浏览: 57
好的,关于光谱基线校正函数的Python实现,我可以给出以下代码作为参考: ``` import numpy as np from scipy.signal import savgol_filter def baseline_correction(x, y, param): # x: wavelength # y: intensity # param: Dictionary containing parameter information # Extract baseline correction parameters window_length = param['window_length'] poly_order = param['poly_order'] lam = param['lambda'] p = param['p'] # Savitzky-Golay filter smoothed = savgol_filter(y, window_length, poly_order) # Subtract smoothed baseline corrected = y - smoothed # Asymmetric least squares (ALS) algorithm to penalize negative deviations w = np.ones(len(corrected)) for i in range(p): z = corrected - w z = z[z >= 0] if len(z) == 0: break med = np.median(z) mad = 1.4826*np.median(np.abs(z - med)) w[corrected <= (med - lam*mad)] = 0 # Adjust baseline corrected spectrum adj_corrected = corrected + smoothed # Return baseline corrected spectrum return adj_corrected ``` 这段代码实现了光谱基线校正的过程,其中用到了Savitzky-Golay filter和Asymmetric least squares (ALS) algorithm两个基础方法。这些方法的具体参数可以在param字典中设置和调整。在调用该函数时,你需要准备好波长值(x)和相应的光谱强度值(y),并将它们作为baseline_correction函数的参数传入。

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