用pytorch实现带残差结构的图神经网络,且接受批量训练,最终用于图分类任务
时间: 2024-01-29 12:03:20 浏览: 26
好的,我可以为您提供一个简单的带残差结构的图神经网络的 PyTorch 实现,用于图分类任务,且支持批量训练。
首先,我们需要导入 PyTorch 和其他必要的库:
```python
import torch
import torch.nn as nn
import torch.nn.functional as F
```
接下来,我们定义一个带残差结构的 GCN(图卷积网络)模型。这里我们使用两个 GCN 层,并在它们之间添加了一个残差连接。每个 GCN 层都包含两个线性变换和一个 ReLU 激活函数。输入特征大小为 `in_features`,输出特征大小为 `out_features`,隐藏层大小为 `hidden_size`,邻接矩阵为 `adj`。
```python
class GCN(nn.Module):
def __init__(self, in_features, hidden_size, out_features, adj):
super(GCN, self).__init__()
self.adj = adj
self.gcn1 = nn.Sequential(
nn.Linear(in_features, hidden_size),
nn.ReLU(),
nn.Linear(hidden_size, out_features)
)
self.gcn2 = nn.Sequential(
nn.Linear(in_features, hidden_size),
nn.ReLU(),
nn.Linear(hidden_size, out_features)
)
def forward(self, x):
x1 = torch.spmm(self.adj, self.gcn1(x))
x2 = torch.spmm(self.adj, self.gcn2(x1))
return x1 + x2 + x
```
在这个模型中,我们使用了 PyTorch 的稀疏矩阵乘法函数 `torch.spmm` 来实现 GCN 层。我们还定义了 `forward` 函数来执行前向传递,其中 `x` 是输入的节点特征矩阵,`x1` 和 `x2` 是两个 GCN 层的输出,`x1 + x2 + x` 是残差连接的输出。
最后,我们定义一个包含多个 GCN 层的图神经网络模型,并在其顶部添加一个线性层和一个 softmax 激活函数。这个模型接受一个节点特征矩阵和邻接矩阵作为输入,并输出一个大小为 `num_classes` 的概率分布。
```python
class ResGCN(nn.Module):
def __init__(self, in_features, hidden_size, out_features, adj, num_classes):
super(ResGCN, self).__init__()
self.gcn1 = GCN(in_features, hidden_size, out_features, adj)
self.gcn2 = GCN(out_features, hidden_size, out_features, adj)
self.linear = nn.Linear(out_features, num_classes)
def forward(self, x):
x = F.relu(self.gcn1(x))
x = self.gcn2(x) + x
x = F.softmax(self.linear(x), dim=1)
return x
```
在这个模型中,我们使用了两个 GCN 层,并在它们之间添加了一个残差连接。我们还添加了一个线性层和一个 softmax 激活函数来输出概率分布。在 `forward` 函数中,我们首先对输入进行一个 ReLU 激活,然后使用第一个 GCN 层进行处理。接着,我们将其输出与输入相加,并将其输入到第二个 GCN 层中。最后,我们将其输入到线性层和 softmax 激活函数中,得到概率分布。
接下来,我们可以使用这个模型来进行图分类任务的训练和测试。为了进行批量训练,我们需要将节点特征矩阵和邻接矩阵打包成一个张量,并在训练时指定批量大小。
```python
model = ResGCN(in_features, hidden_size, out_features, adj, num_classes)
optimizer = torch.optim.Adam(model.parameters(), lr=learning_rate)
for epoch in range(num_epochs):
for i in range(0, num_samples, batch_size):
batch_x = x[i:i+batch_size]
batch_adj = adj[i:i+batch_size]
batch_y = y[i:i+batch_size]
logits = model(batch_x, batch_adj)
loss = F.cross_entropy(logits, batch_y)
optimizer.zero_grad()
loss.backward()
optimizer.step()
with torch.no_grad():
logits = model(x, adj)
preds = torch.argmax(logits, dim=1)
accuracy = (preds == y).float().mean()
print(f"Epoch {epoch+1}/{num_epochs}, Loss: {loss:.4f}, Accuracy: {accuracy:.4f}")
```
在训练过程中,我们首先将节点特征矩阵和邻接矩阵打包成一个张量,并在每个批次中使用它们来计算预测值和损失。然后我们执行反向传播和优化器的更新。在每个 epoch 结束时,我们计算模型在整个数据集上的准确率,并输出训练的损失和准确率。
希望这个简单的 PyTorch 实现能够为您提供一些帮助。如果您有任何问题或需要进一步的帮助,请随时告诉我。