denclue算法python
时间: 2023-07-10 19:16:53 浏览: 37
DenClue算法是一种基于密度的聚类算法,可以用于在高维数据中发现聚类结构。下面是一个简单的Python实现:
```python
import numpy as np
from scipy.spatial.distance import cdist
def denclue(data, h, eps):
n, d = data.shape
density = np.zeros(n)
gradient = np.zeros((n, d))
h_squared = h ** 2
def kernel(x):
return np.exp(-np.sum(x ** 2) / h_squared)
def gradient_kernel(x):
return -2 * x / h_squared * kernel(x)
# 计算每个数据点的局部密度和梯度
for i in range(n):
for j in range(n):
x = data[i] - data[j]
density[i] += kernel(x)
gradient[i] += gradient_kernel(x)
# 迭代计算聚类中心
centers = []
while True:
max_index = np.argmax(density)
if density[max_index] < eps:
break
center = data[max_index]
centers.append(center)
density[max_index] = 0
# 调整密度和梯度
for i in range(n):
x = data[i] - center
density[i] -= kernel(x)
gradient[i] -= gradient_kernel(x)
# 分配每个数据点到最近的聚类中心
labels = np.zeros(n)
for i in range(n):
distances = cdist(data[i:i+1], centers)
labels[i] = np.argmin(distances)
return labels
```
其中,`data`是一个$n\times d$的numpy数组,表示$n$个$d$维数据点;`h`是一个标量,表示高斯核的带宽;`eps`是一个标量,表示密度阈值。函数返回一个长度为$n$的numpy数组,表示每个数据点所属的聚类。