Error in UseMethod("st_write") : no applicable method for 'st_write' applied to an object of class "c('SpatialPointsDataFrame', 'SpatialPoints', 'Spatial', 'SpatialVector')"

这个错误提示是因为您使用了`st_write()`函数导出了一个`SpatialPointsDataFrame`对象，而`st_write()`函数是sf包中的函数，仅能用于sf对象，因此不能直接对`SpatialPointsDataFrame`对象进行导出。

如果您想要使用sf包导出数据，需要先将`SpatialPointsDataFrame`对象转换为sf对象。可以使用`st_as_sf()`函数将`SpatialPointsDataFrame`对象转换为sf对象，例如：

library(sf)

# 读入R中的数据
data_spdf <- read.table("data.txt", header=TRUE)

# 将SpatialPointsDataFrame对象转换为sf对象
data_sf <- st_as_sf(data_spdf, coords=c("lon", "lat"), crs=4326)

# 设置输出文件路径和名称
output_file <- "output.shp"

# 导出数据为shp文件
st_write(data_sf, output_file)

这样，就可以将`SpatialPointsDataFrame`对象导出为shp文件了。请注意，导出的文件会保存在当前工作目录中。

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Error in UseMethod("mutate") : no applicable method for 'mutate' applied to an object of class "character"

这个错误提示表示你正在尝试对一个字符向量或字符串进行 mutate() 操作，但是 mutate() 函数只能应用于数据框或列表等类似于数据框的对象。因此，R 无法找到适用于字符向量的 mutate() 方法，从而导致错误。

要解决这个问题，你需要确保你正在对正确的对象进行 mutate() 操作。首先，你可以使用 str() 函数检查对象的类别：

str(your_object)

如果它是一个字符向量，那么你需要找到一个方法来将它转换为数据框或列表。你可以使用 as.data.frame() 函数将字符向量转换为数据框：

your_data <- as.data.frame(your_vector)

然后你可以使用 mutate() 函数对数据框进行操作。如果你的对象已经是一个数据框或列表，那么你需要检查一下你的 mutate() 语法是否正确。例如，要在数据框中添加一个新的列，你可以使用以下语法：

your_data <- mutate(your_data, new_column = some_transformation(old_column))

其中 some_transformation 是你要应用于旧列的一些函数或变换，old_column 是旧列的名称。请确保你的语法正确，并且你正在对正确的对象进行操作。

Error in UseMethod("filter") : no applicable method for 'filter' applied to an object of class "function"

这个错误通常是因为没有正确加载dplyr包导致的。请先使用`library(dplyr)`命令加载dplyr包，然后再运行filter函数。

如果已经加载了dplyr包，仍然出现这个错误，可能是由于函数名与dplyr包中的函数名重复导致的。可以尝试使用`dplyr::filter()`来明确调用dplyr包中的filter函数，以避免命名冲突。另外，也需要检查数据对象是否正确定义和调用。