用R语言计算一个LDA的误分类率
时间: 2023-07-24 12:39:47 浏览: 110
线性判别分析(LDA)分析及相关R语言code
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计算LDA的误分类率可以使用交叉验证的方法。具体步骤如下:
1. 将数据集随机分成K个子集,其中一个子集作为测试集,其余K-1个子集作为训练集。
2. 在训练集上进行LDA模型的拟合。
3. 使用训练好的模型对测试集进行预测,记录误分类数。
4. 重复1-3步骤K次,得到K个误分类数。
5. 计算平均误分类率。
下面是用R语言实现上述步骤的代码:
```r
library(MASS) # 导入MASS包,里面包含LDA函数
# 生成示例数据
set.seed(123)
x1 <- rnorm(50, mean = 0, sd = 1)
y1 <- rnorm(50, mean = 0, sd = 1)
x2 <- rnorm(50, mean = 2, sd = 1)
y2 <- rnorm(50, mean = 2, sd = 1)
data <- data.frame(x = c(x1, x2), y = c(y1, y2), group = c(rep(1, 50), rep(2, 50)))
# 交叉验证计算误分类率
K <- 5 # K折交叉验证
n <- nrow(data)
set.seed(456)
folds <- sample(rep(1:K, length.out = n)) # 将数据集分成K个子集
error_count <- 0
for (i in 1:K) {
train <- data[folds != i, ]
test <- data[folds == i, ]
lda_model <- lda(group ~ x + y, data = train) # 在训练集上拟合LDA模型
pred <- predict(lda_model, newdata = test)$class # 预测测试集的类别
error_count <- error_count + sum(pred != test$group) # 计算误分类数
}
error_rate <- error_count / n # 计算平均误分类率
error_rate
```
其中,我使用了MASS包中的LDA函数来拟合LDA模型,使用了交叉验证的方法计算误分类率。这里的示例数据是二维正态分布,共有两个类别,每个类别包含50个样本。你可以根据自己的数据进行修改。
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