lammps in文件

LAMMPS是一个用于分子动力学模拟的软件包，用于模拟原子、分子和其他粒子的行为。以下是一个LAMMPS输入文件的示例：

#定义模拟类型和单位

units real

dimension 3

boundary p p p

atom_style atomic

#定义原子种类和相互作用势能

read_data data.file

pair_style lj/cut 2.5

pair_coeff 1 1 1.0 1.0 2.5

#定义温度和时间步长

velocity all create 300.0 12345 dist gaussian

timestep 0.01

#定义能量最小化和动力学模拟

min_style cg

minimize 1.0e-8 1.0e-12 1000 10000

fix 1 all nve

run 10000

#输出结果

thermo_style custom step temp etotal press

thermo 100

dump 1 all atom 100 dump.file

run 100000

此输入文件将读取一个名为data.file的数据文件，其中包含原子的初始位置、速度和其他属性。它使用Lennard-Jones势能模拟原子之间的相互作用，并将温度设置为300K。模拟将进行10000个能量最小化步骤，然后进行10000个动力学模拟步骤。输出结果将在每个100个步骤处记录一次，并将数据存储在dump.file中。最后，模拟将运行另外100000个步骤，以获得更多数据。