用matlab做传染病模型拟合
时间: 2023-12-18 22:05:47 浏览: 195
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传染病模型拟合需要确定一个数学模型,并用实际数据对其进行参数估计。常用的传染病模型包括SIR模型、SEIR模型等,这些模型都可以用matlab进行模拟和拟合。
以下是一个使用matlab进行SIR模型拟合的示例代码:
```matlab
% 导入数据
data = readtable('data.xlsx');
t = data.Time;
y = data.Cases;
% 定义模型函数
sir = @(t,beta,gamma,x0) x0.*[1;diff(exp((beta-gamma)*t))*beta/gamma];
% 定义误差函数
sirErr = @(params) sum((y-sir(t,params(1),params(2),params(3))).^2);
% 初始参数估计
params0 = [0.2,0.05,0.01];
% 最小化误差函数
params = fminsearch(sirErr,params0);
% 绘制拟合图像
plot(t,y,'o',t,sir(t,params(1),params(2),params(3)));
legend('实际数据','SIR模型拟合');
xlabel('时间');
ylabel('感染人数');
```
在这个示例中,我们首先导入了包含感染人数和时间的数据文件;然后定义了SIR模型函数和误差函数;接着使用fminsearch函数最小化误差函数,得到最佳参数估计;最后绘制了实际数据和模型拟合图像。
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