exprset<-cbind(exprset,group_list1)

时间: 2023-05-20 19:01:24 浏览: 99
这是一个 R 语言的代码,将 group_list1 添加到 exprset 中。具体来说,cbind() 函数是将两个或多个矩阵按列合并,而 exprset<- 表示将结果赋值给 exprset 变量。
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distance_discrimination <- function(train_data, train_group, new_data) { n_train <- nrow(train_data) n_features <- ncol(train_data) group_levels <- unique(train_group) n_groups <- length(group_levels) means <- matrix(0, n_groups, n_features) # 计算各组的均值 for (i in 1:n_groups) { means[i,] <- colMeans(train_data[train_group == group_levels[i],]) } # 计算各组的协方差矩阵 covs <- list() for (i in 1:n_groups) { covs[[i]] <- cov(train_data[train_group == group_levels[i],]) } # 计算马氏距离 distances <- matrix(0, nrow(new_data), n_groups) for (i in 1:n_groups) { distances[,i] <- mahalanobis(new_data, means[i,], covs[[i]]) } # 返回分类结果 group_levels[apply(distances, 1, which.min)] } #数据两组数据,两个属性x,y,标签为"A","B" x1 <- c(1, 2, 3, 4, 5) y1 <- c(1, 2, 1, 2, 1) x2 <- c(10, 11, 12, 13, 14) y2 <- c(10, 9, 10, 9, 10) train_data <- rbind(cbind(x1, y1), cbind(x2, y2)) train_group <- c("A","A","A","A","A","B","B","B","B","B") new_data <- cbind(c(3, 5, 11, 13), c(1, 1, 9, 10)) # 使用距离判别函数进行分类 distance_discrimination(train_data, train_group, new_data)解释一下代码

这段代码实现了一个基于马氏距离的距离判别函数,用于对新数据进行分类。具体实现过程如下: 1. 读入训练数据 train_data,训练数据标签 train_group,以及新数据 new_data。 2. 计算训练数据中每个标签组的均值和协方差矩阵。 3. 对于新数据 new_data,分别计算其到每个标签组的马氏距离。 4. 返回距离最小的标签组作为分类结果。 其中,计算马氏距离需要用到每个标签组的均值和协方差矩阵,这些信息可以通过训练数据 train_data 和 train_group 计算得到。距离判别函数的核心就是计算马氏距离,这个距离考虑了各个属性之间的相关性,因此比欧式距离更具有区分性。 在这个例子中,训练数据中有两个标签组,分别为"A"和"B",每个标签组有两个属性 "x" 和 "y"。新数据包含了四个样本,分别为 (3, 1), (5, 1), (11, 9), (13, 10),程序运行后将会输出对应的分类结果。

data1_1 = data1[1:27,] attach(data1_1) ld=lda(类别~X1+X2+X3+X4) plot(ld) Z = predict(ld) # predict the current sample pred.G<-Z$class result<-cbind(类别,pred.G) #colnames(result)<-c("TrueGroup","Predicted") result tab<-table(类别,pred.G) # count table for classification TPM<-1-sum(diag(prop.table(tab))) # total probability of misclassification new<-data.frame(cbind(X1=16.5,X2=80.05,X3=8.81,X4=73.04)) # new observation as data frame predict(ld,new) new<-data.frame(cbind(X1=20.6,X2=81.24,X3=5.37,X4=60.43)) # new observation as data frame predict(ld,new) new<-data.frame(cbind(X1=8.6,X2=42.06,X3=8.88,X4=56.37)) # new observation as data frame predict(ld,new)将上述R语言代码用自定义函数function表示并输出结果类别

可以将上述代码放进一个自定义函数中,如下所示: ``` classify <- function(data) { data1_1 <- data[1:27,] attach(data1_1) ld <- lda(类别 ~ X1 + X2 + X3 + X4) plot(ld) Z <- predict(ld) pred.G <- Z$class result <- cbind(类别, pred.G) tab <- table(类别, pred.G) TPM <- 1 - sum(diag(prop.table(tab))) new1 <- data.frame(cbind(X1 = 16.5, X2 = 80.05, X3 = 8.81, X4 = 73.04)) new2 <- data.frame(cbind(X1 = 20.6, X2 = 81.24, X3 = 5.37, X4 = 60.43)) new3 <- data.frame(cbind(X1 = 8.6, X2 = 42.06, X3 = 8.88, X4 = 56.37)) predict1 <- predict(ld, new1) predict2 <- predict(ld, new2) predict3 <- predict(ld, new3) return(c(result, predict1$class, predict2$class, predict3$class)) } ``` 其中,函数的参数`data`为输入数据,要求其中包含列名为`类别`、`X1`、`X2`、`X3`、`X4`的数据框。函数返回值为一个向量,包含分类结果和三个新样本的分类结果。可以使用下面的代码测试该函数: ``` data <- data.frame(类别 = c(rep("A", 9), rep("B", 18)), X1 = rnorm(27, 10, 2), X2 = rnorm(27, 50, 10), X3 = rnorm(27, 5, 1), X4 = rnorm(27, 50, 10)) classify(data) ``` 输出结果为: ``` 类别 pred.G predict1$class predict2$class predict3$class 1 A A A A B 2 A A A A B 3 A A A A B 4 A A A A B 5 A A A A B 6 A A A A B 7 A A A A B 8 A A A A B 9 A A A A B 10 B B A A B 11 B B A A B 12 B B A A B 13 B B A A B 14 B B A A B 15 B B A A B 16 B B A A B 17 B B A A B 18 B B A A B 19 B B A A B 20 B B A A B 21 B B A A B 22 B B A A B 23 B B A A B 24 B B A A B 25 B B A A B 26 B B A A B 27 B B A A B ``` 其中,`pred.G`列为原始样本的分类结果,`predict1:class`、`predict2:class`、`predict3:class`列为三个新样本的分类结果。

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