已有感染者、治愈者、死亡者数据,用最小二乘法拟合SEIR模型治愈率、死亡率的matlab完整代码

时间: 2023-12-28 08:17:45 浏览: 31
以下是基于最小二乘法拟合SEIR模型中治愈率和死亡率的Matlab完整代码: ```matlab % 导入数据并进行预处理 data = importdata('data.txt'); % 从文件中导入数据 t = data(:,1); % 时间序列 I = data(:,2); % 感染者数目 R = data(:,3); % 治愈者数目 D = data(:,4); % 死亡者数目 N = 1000000; % 总人口数 E0 = 0; % 初始时刻潜伏者数目 I0 = I(1); % 初始时刻感染者数目 R0 = R(1); % 初始时刻治愈者数目 D0 = D(1); % 初始时刻死亡者数目 S0 = N - E0 - I0 - R0 - D0; % 初始时刻易感者数目 % 定义SEIR函数 seir = @(t,x) [-beta*x(1)*x(2)/N; beta*x(1)*x(2)/N - sigma*x(2); sigma*x(2) - gamma*x(3); gamma*x(3); delta*x(3)]; % 初始参数猜测 beta = 0.2; sigma = 0.1; gamma = 0.05; delta = 0.01; % 最小二乘法拟合 fun = @(x) sum((R - x(1).*cumsum(I)/N - x(2).*cumsum(I)/N - D).^2); % 定义目标函数 lb = [0, 0]; % 下限 ub = [1, 1]; % 上限 x0 = [0.2, 0.05]; % 初值 options = optimoptions('fmincon','Display','iter','Algorithm','sqp'); % 优化选项 x = fmincon(fun,x0,[],[],[],[],lb,ub,[],options); % 最小二乘法求解 % 模拟SEIR模型 [tout,yout] = ode45(seir,t,[S0;E0;I0;R0;D0],[],beta,sigma,gamma,delta); % 绘制拟合结果 figure; plot(t,R,'o','LineWidth',2,'MarkerSize',10); hold on; plot(t,x(1).*cumsum(I)/N + x(2).*cumsum(I)/N + D,'r-','LineWidth',2); xlabel('时间(天)','FontSize',14); ylabel('人数','FontSize',14); legend('实际数据','拟合结果','FontSize',12); title(['最小二乘法拟合SEIR模型:治愈率=',num2str(x(1)),', 死亡率=',num2str(x(2))],'FontSize',14); grid on; % 绘制SEIR模型结果 figure; plot(tout,yout(:,1),'b-','LineWidth',2); hold on; plot(tout,yout(:,2),'r-','LineWidth',2); plot(tout,yout(:,3),'g-','LineWidth',2); plot(tout,yout(:,4),'m-','LineWidth',2); plot(tout,yout(:,5),'k-','LineWidth',2); xlabel('时间(天)','FontSize',14); ylabel('人数','FontSize',14); legend('易感者','潜伏者','感染者','治愈者','死亡者','FontSize',12); title(['SEIR模型:beta=',num2str(beta),', sigma=',num2str(sigma),', gamma=',num2str(gamma),', delta=',num2str(delta)],'FontSize',14); grid on; ``` 注:数据文件中的数据应该按照时间顺序排列,每一行包括四个数字,分别代表时间、感染者数目、治愈者数目和死亡者数目。

相关推荐

最新推荐

recommend-type

Python实现新型冠状病毒传播模型及预测代码实例

在本篇文章里小编给大家整理的是关于Python实现新型冠状病毒传播模型及预测代码内容,有兴趣的朋友们可以学习下。
recommend-type

k8s1.16的jenkins部署java项目cicd(cd手动)-kubernetes安装包和详细文档笔记整理

k8s1.16的jenkins部署java项目cicd(cd手动)-kubernetes安装包和详细文档笔记整理
recommend-type

sja1311.x86_64.tar.gz

SQLyong 各个版本,免费下载 SQLyog是业界著名的Webyog公司出品的一款简洁高效、功能强大的图形化MySQL数据库管理工具。使用SQLyog可以快速直观地让您从世界的任何角落通过网络来维护远端的MySQL数据库。
recommend-type

debugpy-1.1.0-cp34-cp34m-manylinux1_x86_64.whl

Python库是一组预先编写的代码模块,旨在帮助开发者实现特定的编程任务,无需从零开始编写代码。这些库可以包括各种功能,如数学运算、文件操作、数据分析和网络编程等。Python社区提供了大量的第三方库,如NumPy、Pandas和Requests,极大地丰富了Python的应用领域,从数据科学到Web开发。Python库的丰富性是Python成为最受欢迎的编程语言之一的关键原因之一。这些库不仅为初学者提供了快速入门的途径,而且为经验丰富的开发者提供了强大的工具,以高效率、高质量地完成复杂任务。例如,Matplotlib和Seaborn库在数据可视化领域内非常受欢迎,它们提供了广泛的工具和技术,可以创建高度定制化的图表和图形,帮助数据科学家和分析师在数据探索和结果展示中更有效地传达信息。
recommend-type

zigbee-cluster-library-specification

最新的zigbee-cluster-library-specification说明文档。
recommend-type

管理建模和仿真的文件

管理Boualem Benatallah引用此版本:布阿利姆·贝纳塔拉。管理建模和仿真。约瑟夫-傅立叶大学-格勒诺布尔第一大学,1996年。法语。NNT:电话:00345357HAL ID:电话:00345357https://theses.hal.science/tel-003453572008年12月9日提交HAL是一个多学科的开放存取档案馆,用于存放和传播科学研究论文,无论它们是否被公开。论文可以来自法国或国外的教学和研究机构,也可以来自公共或私人研究中心。L’archive ouverte pluridisciplinaire
recommend-type

MATLAB柱状图在信号处理中的应用:可视化信号特征和频谱分析

![matlab画柱状图](https://img-blog.csdnimg.cn/3f32348f1c9c4481a6f5931993732f97.png) # 1. MATLAB柱状图概述** MATLAB柱状图是一种图形化工具,用于可视化数据中不同类别或组的分布情况。它通过绘制垂直条形来表示每个类别或组中的数据值。柱状图在信号处理中广泛用于可视化信号特征和进行频谱分析。 柱状图的优点在于其简单易懂,能够直观地展示数据分布。在信号处理中,柱状图可以帮助工程师识别信号中的模式、趋势和异常情况,从而为信号分析和处理提供有价值的见解。 # 2. 柱状图在信号处理中的应用 柱状图在信号处理
recommend-type

用Spring boot和vue写一个登录注册界面

好的,这是一个比较常见的技术问题,我可以为您提供一些参考资料和思路。首先,您可以使用Spring Boot作为后端框架来处理用户认证和注册的逻辑,比如使用Spring Security实现用户登录认证。同时,您还需要设计相应的数据模型和数据库表结构来存储用户信息。在前端方面,您可以使用Vue.js作为框架来构建登录注册页面,使用Axios来发起API请求并和后端进行交互。当然,在实现过程中,还需要考虑一些具体细节,比如数据校验、安全性和用户体验等方面。希望这些信息能够帮助到您。
recommend-type

JSBSim Reference Manual

JSBSim参考手册,其中包含JSBSim简介,JSBSim配置文件xml的编写语法,编程手册以及一些应用实例等。其中有部分内容还没有写完,估计有生之年很难看到完整版了,但是内容还是很有参考价值的。
recommend-type

"互动学习:行动中的多样性与论文攻读经历"

多样性她- 事实上SCI NCES你的时间表ECOLEDO C Tora SC和NCESPOUR l’Ingén学习互动,互动学习以行动为中心的强化学习学会互动,互动学习,以行动为中心的强化学习计算机科学博士论文于2021年9月28日在Villeneuve d'Asq公开支持马修·瑟林评审团主席法布里斯·勒菲弗尔阿维尼翁大学教授论文指导奥利维尔·皮耶昆谷歌研究教授:智囊团论文联合主任菲利普·普雷教授,大学。里尔/CRISTAL/因里亚报告员奥利维耶·西格德索邦大学报告员卢多维奇·德诺耶教授,Facebook /索邦大学审查员越南圣迈IMT Atlantic高级讲师邀请弗洛里安·斯特鲁布博士,Deepmind对于那些及时看到自己错误的人...3谢谢你首先,我要感谢我的两位博士生导师Olivier和Philippe。奥利维尔,"站在巨人的肩膀上"这句话对你来说完全有意义了。从科学上讲,你知道在这篇论文的(许多)错误中,你是我可以依