R语言多因素COX回归并将其结果以森林图的形式展现
时间: 2023-09-12 11:07:47 浏览: 140
好的,关于R语言多因素COX回归并将其结果以森林图的形式展现,可以按照以下步骤进行:
1. 准备数据集,包括需要分析的自变量和因变量。
2. 使用“survival”包中的“coxph”函数进行多因素COX回归分析,例如以下代码:
```R
library(survival)
fit <- coxph(Surv(time, status) ~ var1 + var2 + var3, data = data)
```
其中,Surv函数的第一个参数是时间(time),第二个参数是事件状态(status),“~”后面是自变量(var1、var2、var3)。
3. 查看回归结果,例如以下代码:
```R
summary(fit)
```
4. 使用“forestplot”包中的“forestplot”函数进行森林图绘制,例如以下代码:
```R
library(forestplot)
output <- summary(fit)
plot_data <- data.frame(names = output$coef[,4],
coef = exp(output$coef[,1]),
lower = exp(output$coef[,1] - (1.96 * output$coef[,2])),
upper = exp(output$coef[,1] + (1.96 * output$coef[,2])),
p.value = output$coef[,5])
forestplot(plot_data,
is.summary=c(TRUE,rep(FALSE, nrow(plot_data)-1))),
clip=c(0.05, 2),
xlog=TRUE,
col=fpColors(line="black", box="black"),
# add table header
add.table=TRUE,
table=cbind(c("", "coef", "95% CI", "p-value"),
c("", "", "", "")),
new_page=TRUE)
```
其中,“output”变量存储回归结果,然后将其转换为“plot_data”变量,然后使用“forestplot”函数进行绘图。绘图时要注意设置参数,例如“is.summary”表示是否为汇总结果,“clip”表示截断范围,“xlog”表示横坐标是否取对数,“col”表示颜色设置,“add.table”表示是否添加表头,“table”表示表头内容,“new_page”表示是否新建一页进行绘图。
绘制的森林图可以展示每个自变量的系数、置信区间和p值,可以帮助我们更加直观地理解多因素COX回归的结果。
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