现在我在E盘pssm我文件夹下有许多pssm文件如何先将冗余的相反极性氨基酸的数据删除再批量将其中的矩阵部分导出

要先将冗余的相反极性氨基酸的数据删除，可以使用PSSM数据处理软件，比如说NCBI CD-Search。具体操作步骤如下：

1. 打开NCBI CD-Search网站（https://www.ncbi.nlm.nih.gov/Structure/bwrpsb/bwrpsb.cgi）。
2. 点击“PSSM Viewer”进入PSSM查看器。
3. 选择要处理的PSSM文件，并点击“Submit”按钮。
4. 在PSSM查看器中，选择“Edit”菜单下的“Trim Row”选项。
5. 在“Trim Row”对话框中，选择要删除的氨基酸类型，比如说相反极性氨基酸，然后点击“OK”按钮。
6. 在PSSM查看器中，选择“File”菜单下的“Save As”选项，将处理后的PSSM文件保存到本地。

处理完PSSM文件后，可以使用Python等编程语言来批量导出其中的矩阵部分。具体操作步骤如下：

1. 使用Python的os库或glob库读取PSSM文件夹下的所有PSSM文件。
2. 使用Python的pandas库读取每个PSSM文件，并将矩阵部分存储到一个DataFrame中。
3. 使用Python的to_csv方法将每个DataFrame导出到CSV文件中。
4. 如果需要将多个CSV文件合并为一个文件，可以使用Python的pandas库或csv库来实现。