批量将ct扫描的dicom 序列图像转化成nii三维图像利用python

可以使用Python中的pydicom库来读取DICOM文件，并使用SimpleITK库将读取的DICOM文件序列转换为NIfTI格式。以下是一个示例代码：

import os
import pydicom
import SimpleITK as sitk

# 定义DICOM文件路径和输出文件路径
dicom_path = "path/to/dicom/files/"
out_path = "path/to/output/nifti/file.nii.gz"

# 读取DICOM序列并将其转换为NIfTI格式
reader = sitk.ImageSeriesReader()
series_ids = reader.GetGDCMSeriesIDs(dicom_path)
if not series_ids:
    print("No DICOM files found in the directory!")
    exit()
series_id = series_ids[0]
file_names = reader.GetGDCMSeriesFileNames(dicom_path, series_id)
dcm_files = []
for file_name in file_names:
    ds = pydicom.dcmread(file_name)
    dcm_files.append(ds)
reader.SetFileNames(file_names)
image = reader.Execute()
sitk.WriteImage(image, out_path)

使用这个代码，你可以将一个DICOM序列文件夹转换为一个NIfTI文件。注意，你需要在代码中使用正确的输入DICOM目录路径和输出NIfTI文件路径。