解释这段代码:import numpy as np def icc_calculate(Y, icc_type): [n, k] = Y.shape # 自由度 dfall = n * k - 1 # 所有自由度 dfe = (n - 1) * (k - 1) # 剩余自由度 dfc = k - 1 # 列自由度 dfr = n - 1 # 行自由度 # 所有的误差 mean_Y = np.mean(Y) SST = ((Y - mean_Y) ** 2).sum() x = np.kron(np.eye(k), np.ones((n, 1))) # sessions x0 = np.tile(np.eye(n), (k, 1)) # subjects X = np.hstack([x, x0]) # 误差均方 predicted_Y = np.dot( np.dot(np.dot(X, np.linalg.pinv(np.dot(X.T, X))), X.T), Y.flatten("F") ) residuals = Y.flatten("F") - predicted_Y SSE = (residuals ** 2).sum() MSE = SSE / dfe # 列均方 SSC = ((np.mean(Y, 0) - mean_Y) ** 2).sum() * n MSC = SSC / dfc # 行均方 SSR = ((np.mean(Y, 1) - mean_Y) ** 2).sum() * k MSR = SSR / dfr if icc_type == "icc(1)": SSW = SST - SSR # 剩余均方 MSW = SSW / (dfall - dfr) ICC1 = (MSR - MSW) / (MSR + (k - 1) * MSW) ICC2 = (MSR - MSW) / MSR elif icc_type == "icc(2)": ICC1 = (MSR - MSE) / (MSR + (k - 1) * MSE + k * (MSC - MSE) / n) ICC2 = (MSR - MSE) / (MSR + (MSC - MSE) / n) elif icc_type == "icc(3)": ICC1 = (MSR - MSE) / (MSR + (k - 1) * MSE) ICC2 = (MSR - MSE) / MSR return ICC1, ICC2
时间: 2023-06-08 19:06:39 浏览: 248
这段代码是Python语言的代码,它使用了NumPy库,并定义了一个函数icc_calculate,它有两个参数,分别是Y和icc_type。
Y是一个numpy数组,它的形状是[n,k],n和k分别是数组的行数和列数。
该函数的作用是计算一个ICC(Intraclass Correlation Coefficient)统计量,它可以用来评估同一组观测数据在不同的条件下的一致性。
具体的计算方法根据不同的ICC类型而有所不同,该函数通过输入的icc_type参数来确定计算方法,并返回计算结果。
阅读全文