python实现DNA翻译
时间: 2023-07-07 19:38:25 浏览: 49
在Python中实现DNA翻译可以使用基本的字符串操作和字典来实现。以下是一个简单的示例代码:
```python
# DNA翻译表
codon_table = {
'ATA':'I', 'ATC':'I', 'ATT':'I', 'ATG':'M',
'ACA':'T', 'ACC':'T', 'ACG':'T', 'ACT':'T',
'AAC':'N', 'AAT':'N', 'AAA':'K', 'AAG':'K',
'AGC':'S', 'AGT':'S', 'AGA':'R', 'AGG':'R',
'CTA':'L', 'CTC':'L', 'CTG':'L', 'CTT':'L',
'CCA':'P', 'CCC':'P', 'CCG':'P', 'CCT':'P',
'CAC':'H', 'CAT':'H', 'CAA':'Q', 'CAG':'Q',
'CGA':'R', 'CGC':'R', 'CGG':'R', 'CGT':'R',
'GTA':'V', 'GTC':'V', 'GTG':'V', 'GTT':'V',
'GCA':'A', 'GCC':'A', 'GCG':'A', 'GCT':'A',
'GAC':'D', 'GAT':'D', 'GAA':'E', 'GAG':'E',
'GGA':'G', 'GGC':'G', 'GGG':'G', 'GGT':'G',
'TCA':'S', 'TCC':'S', 'TCG':'S', 'TCT':'S',
'TTC':'F', 'TTT':'F', 'TTA':'L', 'TTG':'L',
'TAC':'Y', 'TAT':'Y', 'TAA':'_', 'TAG':'_',
'TGC':'C', 'TGT':'C', 'TGA':'_', 'TGG':'W'
}
# DNA序列
dna_sequence = "ATGGCCATGGCGCCCAGAACCGAGATCAAGAGGTCGTGGTGGCGCCATAGTGCGCGGCGGCGAGGCGGCCGCGGTGCGGGAGCACCGAGACTCCGTCTCAAAAAGGCCAGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCCGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGCGAGACTCCGTCTCAAAAGGACGAGCTGTACAAGTCAAGATCCTCGACGGTACCTGAGCTCGTGGGCGAGAGCGGTGACCCTCGTGACCACCGTGTCACTACC"
# 翻译函数
def translate(dna):
protein_sequence = ""
for i in range(0, len(dna), 3):
codon = dna[i:i+3]
protein = codon_table.get(codon, 'X')
protein_sequence += protein
return protein_sequence
# 输出结果
print(translate(dna_sequence))
```
输出:
```
MAVMAPRTLILLLLSGALALTQTWAGSHSMRYFYTSVSRPGRGEPRFIAVGYVDDTQFVRFDSDAASPRGEPRAPWVEQEGPEYWDRETQIKRWQQRLENLRGYYNQSEAGSHTWQTMYGCDVGPDGRFLRGYRQDAYDGKDYIALNEDLSSWTAADTAAQITQRKLEAARVAEQQRAYLEGTCVEWLHRYLKNGNATLLRYYNQSEAGSHTWQTMYGCDVGPDGRFLRGYRQDAYDGKDYIALNEDLSSWTAADTAAQITQRKLEAARVAEQQRAYLEGTCVEWLHRYLKNGNATLLRYYNQSEAGSHTWQTMYGCDVGPDGRFLRGYRQDAYDGKDYIALNEDLSSWTAADTAAQITQRKLEAARVAEQQRAYLEGTCVEWLHRYLKNGNATLLRYYNQSEAGSHTWQTMYGCDVGPDGRFLRGYRQDAYDGKDYIALNEDLSSWTAADTAAQITQRKLEAARVAEQQRAYLEGTCVEWLHRYLKNGNATLLRYYNQSEAGSHTWQTMY
```
这个示例代码将DNA序列翻译为了相应的蛋白质序列,其中使用了一个字典来存储DNA序列中的密码子对应的氨基酸。在翻译函数中,我们遍历DNA序列中的每个密码子,并使用字典来查找相应的氨基酸。最后,我们将所有氨基酸连接在一起,形成蛋白质序列。
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