admixture可视化R语言代码
时间: 2023-07-24 17:41:37 浏览: 350
R语言可视化
以下是Admixture结果可视化的R语言代码示例:
```R
# 导入Admixture的结果文件
data <- read.table("result.q")
# 绘制堆叠条形图
barplot(t(data), col = rainbow(ncol(data)), border = NA, space = 0, ylab = "Ancestry", xlab = "Sample ID", main = "Admixture Results")
# 添加图例
legend("topright", c(paste0("Ancestry ", 1:ncol(data))), fill = rainbow(ncol(data)), border = NA)
```
解释:上述代码中,先导入Admixture结果文件,然后使用R语言的`barplot`函数绘制堆叠条形图,其中每一个样本对应一个条形,每个条形被分成不同颜色的部分,代表该样本来自不同祖先的贡献。最后使用`legend`函数添加图例,以便更好地理解图形。
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