5折交叉验证r代码,用bootstrap包中的crossval函数
时间: 2024-02-28 15:55:38 浏览: 68
以下是使用 bootstrap 包中的 `crossval` 函数进行 5 折交叉验证的 R 代码示例:
```
library(bootstrap)
# 加载数据
data(iris)
# 定义模型
model <- function(train, test) {
fit <- randomForest(Species ~ ., data=train)
pred <- predict(fit, newdata=test)
return(pred)
}
# 进行交叉验证
cv <- crossval(data=iris, model=model, k=5)
# 打印结果
print(cv)
```
在这个示例中,我们定义了一个 `model` 函数,该函数使用随机森林算法训练模型并进行预测。然后,我们使用 `crossval` 函数进行 5 折交叉验证,并打印出结果。
相关问题
r语言中的bootstrap()函数的使用方法
R语言中的bootstrap()函数是boot包中的核心函数之一,用于执行bootstrap方法。bootstrap()函数的基本语法如下:
```
bootstrap(data, statistic, R = 500, ...)
```
其中,参数说明如下:
- data:一个向量、矩阵或数据框,表示原始数据集。
- statistic:一个函数,表示需要估计的统计量。
- R:一个整数,表示bootstrap的重复次数,默认值为500。
- ...:其他参数,用于传递给statistic函数。
bootstrap()函数的返回值是一个boot对象,包含了bootstrap的结果,包括估计值、置信区间等。可以使用boot.ci()函数来计算置信区间和假设检验。
下面是一个简单的示例,演示如何使用bootstrap()函数进行bootstrap:
```
library(boot)
# 准备原始数据集
data <- rnorm(100)
# 定义统计量函数
mean_func <- function(data, i) {
return(mean(data[i]))
}
# 进行bootstrap
boot_result <- bootstrap(data, mean_func, R = 1000)
# 计算置信区间
boot_ci <- boot.ci(boot_result)
# 输出结果
print(boot_result)
print(boot_ci)
```
在上面的示例中,我们生成了一个包含100个随机数的数据集,并定义了一个计算均值的函数。然后使用bootstrap()函数进行bootstrap,重复次数为1000次。最后使用boot.ci()函数计算置信区间,并输出结果。
需要注意的是,bootstrap()函数也有一些高级参数,可以用于控制bootstrap的方式和结果。详细的说明可以参考boot包的帮助文档。
使用bagging回归模型进行10折交叉验证
Bagging(Bootstrap aggregating)是一种集成学习方法,它通过对训练集进行自助采样(bootstrap)来生成多个子训练集,然后分别训练多个基学习器,并将它们的结果进行平均或投票来得到最终预测结果。在R语言中,可以使用bagging函数来构建基于决策树的bagging模型,并进行10折交叉验证,具体步骤如下:
1. 首先,加载所需的包和数据集:
```
library(ipred)
data(Boston)
```
2. 对数据集进行自助采样,生成多个子训练集:
```
set.seed(123)
boot_samples <- bagging(1:nrow(Boston), nbag=25)
```
这里设置了nbag=25,表示生成25个子训练集。
3. 使用bagging函数构建回归模型:
```
bagged_model <- bagging(medv ~ ., data=Boston, nbagg=25)
```
这里使用medv作为因变量,使用数据集Boston来训练回归模型,并生成25个基学习器。
4. 使用bagged_model对测试集进行预测,并计算均方误差(MSE):
```
set.seed(123)
cv_results <- bagging.cv(medv ~ ., data=Boston, nbagg=25, k=10,
keep.fitted=FALSE, verbose=TRUE)
mse <- mean(cv_results$err)
```
这里使用了bagging.cv函数进行10折交叉验证,并计算了均方误差。其中,keep.fitted=FALSE表示不保存每个子训练集对应的模型拟合结果,verbose=TRUE表示输出交叉验证的详细信息。
需要注意的是,这里使用了Boston数据集进行演示,如果要使用其他数据集,需要根据具体情况进行调整。