R语言使用breast cancer进行逻辑回归建立
时间: 2023-12-30 16:06:09 浏览: 123
好的,下面是使用R语言进行逻辑回归建立的步骤:
1. 载入数据集
首先需要载入数据集,这里以R自带的breast cancer数据集为例,命令为:
```R
data(breastcancer)
```
2. 数据预处理
接着需要对数据进行预处理,包括划分训练集和测试集、变量选择等。这里选择将数据集按8:2的比例划分为训练集和测试集,命令为:
```R
library(caTools)
set.seed(123) # 设置随机种子
split = sample.split(breastcancer$Class, SplitRatio = 0.8)
train = subset(breastcancer, split == TRUE)
test = subset(breastcancer, split == FALSE)
```
然后需要对变量进行选择,选择变量可以使用各种方法,例如Lasso、逐步回归等。这里使用逐步回归的方法,命令为:
```R
library(MASS)
step = stepAIC(train[,1:9], train[,10], direction="both")
train = train[,c("Class", names(step$coefficients)[-1])]
test = test[,c("Class", names(step$coefficients)[-1])]
```
3. 模型建立
接着进行模型建立,这里使用glm函数进行逻辑回归建模,命令为:
```R
model = glm(Class ~., data=train, family=binomial)
```
4. 模型评估
最后进行模型评估,这里使用测试集进行预测并计算准确率、召回率等指标,命令为:
```R
predicted = predict(model, newdata=test[-10], type="response")
predicted = ifelse(predicted > 0.5, "M", "B")
table(test[,10], predicted)
```
以上就是使用R语言进行逻辑回归建立的步骤。
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