MMPBSA windows

MMPBSA在Windows操作系统下也可以使用。不过，要注意一些安装和配置方面的细节。首先，确保你的系统上已经安装了Python 3、GROMACS和AmberTools。接下来，你需要下载和安装gmx_MMPBSA工具包的Windows版本，该工具包可在MMPBSA官方网站上找到。安装完成后，你可以按照文档中提供的指导，运行gmx_MMPBSA命令来执行自由能计算。例如，你可以使用以下命令来计算真空中的势能：g_mmpbsa -f md_0_100_center.xtc -s md_0_100.tpr -n index.ndx -pdie 2 -decomp。该命令将生成两个文件energy_MM.xvg和contrib_MM.dat，这些文件包含了计算得到的能量和贡献信息。请记住，MMPBSA的不同版本可能会有一些差异，因此在安装和使用时，请参考相关文档和官方指南。<span class="em">1</span><span class="em">2</span><span class="em">3</span>
#### 引用[.reference_title]
- *1* [gmx_MMPBSA:gmx_MMPBSA是一种新工具，可根据AMBER的MMPBSA.py和GROMACS文件执行最终状态自由能计算](https://download.csdn.net/download/weixin_42133861/15837208)[target="_blank" data-report-click={"spm":"1018.2226.3001.9630","extra":{"utm_source":"vip_chatgpt_common_search_pc_result","utm_medium":"distribute.pc_search_result.none-task-cask-2~all~insert_cask~default-1-null.142^v93^chatsearchT3_2"}}] [.reference_item style="max-width: 33.333333333333336%"]
- *2* [gmx_MMPBSA的安装以及acpype找不到mopac解决办法](https://blog.csdn.net/li1guangjun/article/details/129118490)[target="_blank" data-report-click={"spm":"1018.2226.3001.9630","extra":{"utm_source":"vip_chatgpt_common_search_pc_result","utm_medium":"distribute.pc_search_result.none-task-cask-2~all~insert_cask~default-1-null.142^v93^chatsearchT3_2"}}] [.reference_item style="max-width: 33.333333333333336%"]
- *3* [Gromacs g_mmpbsa结合能分析](https://blog.csdn.net/xiaolan39/article/details/111632224)[target="_blank" data-report-click={"spm":"1018.2226.3001.9630","extra":{"utm_source":"vip_chatgpt_common_search_pc_result","utm_medium":"distribute.pc_search_result.none-task-cask-2~all~insert_cask~default-1-null.142^v93^chatsearchT3_2"}}] [.reference_item style="max-width: 33.333333333333336%"]
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