导入excel文档，利用python实现，且Gene_id在第一列，使用加权最小二乘法对实验组和对照组求差异基因，并通过贝叶斯检验来矫正多重检验，然后通过P_value<0.05以及|log2 Fold Change|>1进行筛选

在Python中，我们可以使用pandas库来读取Excel文件，NumPy处理数学运算，SciPy库中的最小二乘法函数（如`scipy.stats.linregress`），statsmodels库来进行贝叶斯检验（`statsmodels.stats.multitest.multipletests`），以及matplotlib进行数据可视化。

以下是步骤概述：

1. **导入所需的库**:

   import pandas as pd
   import numpy as np
   from scipy.stats import linregress
   import statsmodels.api as sm
   import matplotlib.pyplot as plt

2. **加载Excel数据**:

   excel_data = pd.read_excel('your_file.xlsx', index_col=0) # 将Gene_id设为索引
   experimental_group = excel_data['实验组']
   control_group = excel_data['对照组']

3. **加权最小二乘法计算差异**:
如果你想要计算的是线性回归的差异，可以使用`linregress`，假设Gene_id作为x轴，表达量作为y轴：

   slope, intercept, _, _, _ = linregress(experimental_group.index, experimental_group)

然后比较实验组和对照组的斜率差异。

4. **贝叶斯校正**:
使用`multipletests`进行多重测试校正（例如FDR方法）：

   p_values_corrected = sm.stats.multipletests(p_values, method='fdr_bh')[1]

5. **筛选结果**:
根据给定阈值筛选显著基因：

   significant_genes = (p_values_corrected < 0.05) & (np.abs(np.log2(experimental_group / control_group)) > 1)

6. **输出或可视化结果**:
可能还需要整理成DataFrame或者绘制 volcano plot展示结果。

记得替换上述代码中的'your_file.xlsx'为实际的文件路径，并根据数据结构调整列名。