超高维数据变量筛选:用R语言对超高维数据进行SIS、ISIS、QCSIS、SIRS,并根据稳定性从上述几个筛选方法中选择最优的方法,写出示例,代码简洁,注释简要
时间: 2024-04-20 07:22:56 浏览: 22
以下是一个使用R语言对超高维数据进行变量筛选的示例代码:
```R
# 安装和加载所需的包
install.packages(c("elasticnet", "glmnet", "qcs", "caret"))
library(elasticnet)
library(glmnet)
library(qcs)
library(caret)
# 导入超高维数据集
data <- read.csv("data.csv")
# 划分训练集和测试集
set.seed(123)
trainIndex <- createDataPartition(data$target, p = 0.7, list = FALSE)
train <- data[trainIndex, ]
test <- data[-trainIndex, ]
# SIS方法
sis <- createSIS(train[, -ncol(train)], train$target)
selected_sis <- train[, sis$var.keep]
# ISIS方法
isis <- createISIS(train[, -ncol(train)], train$target)
selected_isis <- train[, isis$var.keep]
# QCSIS方法
qcsis <- createQCSIS(train[, -ncol(train)], train$target)
selected_qcsis <- train[, qcsis$var.keep]
# SIRS方法
sirs <- createSIRS(train[, -ncol(train)], train$target)
selected_sirs <- train[, sirs$var.keep]
# 使用稳定性选择最优的方法
stability <- data.frame(Method = c("SIS", "ISIS", "QCSIS", "SIRS"),
Stability = c(length(selected_sis), length(selected_isis), length(selected_qcsis), length(selected_sirs)))
best_method <- stability$Method[which.max(stability$Stability)]
# 输出最优方法
print(paste("最优的方法是:", best_method))
# 注释:这段代码使用了elasticnet、glmnet、qcs和caret等R包,通过SIS、ISIS、QCSIS和SIRS方法对超高维数据进行变量筛选,并根据稳定性选择最优的方法。其中,sis$var.keep、isis$var.keep、qcsis$var.keep和sirs$var.keep分别代表每种方法选择的变量。
```
请注意,这只是一个示例代码,具体的数据集和参数设置需要根据实际情况进行调整。