R语言交叉验证平均ROC
时间: 2023-11-29 22:05:07 浏览: 367
R语言画曲线
交叉验证平均ROC是一种评估分类模型性能的方法,它可以通过使用交叉验证数据集来计算多个ROC曲线的平均值。在R语言中,可以使用ROCR包或pROC包来绘制ROC曲线并计算AUC值。此外,可以使用cvAUC包来计算交叉验证下的AUC值和置信区间。以下是一个简单的例子,展示如何使用ROCR包和cvAUC包来计算交叉验证平均ROC:
1. 使用ROCR包计算单个ROC曲线和AUC值:
```
library(ROCR)
pred <- prediction(predicted.values, true.values)
perf <- performance(pred, "tpr", "fpr")
plot(perf)
auc <- performance(pred, "auc")@y.values
```
2. 使用cvAUC包计算交叉验证下的AUC值和置信区间:
```
library(cvAUC)
cv_auc <- cvAUC(true.values, predicted.values, cvControl = cvControl("repeatedcv", repeats = 10))
cv_auc$estimate
cv_auc$ci
```
3. 使用ROCR包和cvAUC包结合计算交叉验证平均ROC:
```
library(ROCR)
library(cvAUC)
cv_perf <- cvPerformance(prediction(predicted.values, true.values), cvControl = cvControl("repeatedcv", repeats = 10))
cv_auc <- cvAUC(true.values, predicted.values, cvControl = cvControl("repeatedcv", repeats = 10))
plot(cv_perf$roc)
abline(0, 1, lty = 2)
```
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