重复性抽样mcmcmatlab代码
时间: 2023-11-25 19:03:17 浏览: 68
重复性抽样是一种用于统计分析和模拟的方法,其目的是从总体中抽取多个样本,以获得更准确的估计和推断。
在Matlab中,可以使用mcmcrun函数来实现重复性抽样。mcmcrun函数使用MCMC(Markov Chain Monte Carlo)方法生成多个样本,以进行后续的统计分析。
以下是一个示例的重复性抽样的mcmcrun代码:
1. 首先,需要定义一个自定义模型函数,用于计算模型输出值。假设模型函数为“my_model”,输入参数为theta,输出值为y。
```matlab
function y = my_model(theta)
% 模型计算
% ...
y = ... % 根据模型计算结果给出输出值
end
```
2. 接下来,需要定义问题的先验分布函数。假设先验分布函数为“my_prior_dist”,输入参数为theta,输出值为先验分布的概率密度。
```matlab
function log_prob = my_prior_dist(theta)
% 先验分布计算
% ...
log_prob = ... % 根据先验分布计算结果给出先验概率密度的对数值
end
```
3. 然后,可以定义数据和观测误差模型。假设数据集为“data”(n维向量),观测误差为“sigma”(标量)。
```matlab
data = ... % 数据集定义
sigma = ... % 观测误差定义
```
4. 最后,使用mcmcrun函数进行重复性抽样。
```matlab
n_warmup = ... % 预热步数
n_samples = ... % 抽样步数
n_chains = ... % 并行抽样的链数
params_init = ... % 参数的初始值设置
% 定义模型选项
model = struct();
model.fun = @my_model;
model.no_data = length(data);
% 定义先验分布选项
prior = struct();
prior.fun = @my_prior_dist;
% 定义观测误差模型选项
data_option = struct();
data_option.data = data;
data_option.sd = sigma;
% 运行重复性抽样
[results, chain] = mcmcrun(model, data_option, params_init, ...
'n_warmup', n_warmup, ...
'n_samples', n_samples, ...
'n_chains', n_chains, ...
'prior', prior);
```
以上是一个简单的重复性抽样的mcmcrun代码示例,可以根据具体问题进行相应的修改和调整。
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