gcn用于分类 python

时间: 2023-09-15 21:03:05 浏览: 46
GCN(Graph Convolutional Network)是一种用于节点分类的深度学习模型。它主要应用于图结构数据的分类任务。Python是一种流行的编程语言,因其简单易学和丰富的第三方库而被广泛应用于各个领域,包括机器学习和深度学习。 GCN基于图的邻接矩阵来建模节点之间的关系,并进行卷积操作来提取节点的特征表示。在节点分类任务中,我们通常已经有了节点的特征矩阵和邻接矩阵。通过使用GCN模型,我们可以利用这些信息来预测每个节点所属的类别。 在使用Python实现GCN模型时,可以使用各种深度学习框架,例如TensorFlow和PyTorch。这些框架提供了用于构建和训练GCN模型的高级API和库函数,从而简化了模型的实现过程。 首先,我们需要将节点的特征矩阵和邻接矩阵加载到Python环境中。然后,我们可以使用深度学习框架的函数来创建GCN模型的网络结构。这个网络结构通常包括多个卷积层和非线性激活函数,以及用于分类的输出层。 在构建完GCN模型之后,我们可以使用训练集数据对模型进行训练,使用验证集数据来调整超参数,并使用测试集数据来评估模型的性能。通过多次迭代训练,我们可以逐渐提高模型的分类准确率。 总结来说,GCN是一种用于节点分类的深度学习模型,而Python则是一种常用的编程语言,可以使用其丰富的第三方库和深度学习框架来实现和训练GCN模型。通过这些工具和技术,我们可以有效地进行图结构数据的分类任务。
相关问题

GCN模型python代码

GCN(图卷积网络)是一种针对图形数据进行学习的深度学习模型,通常用于图分类和图生成等任务。 以下是一个简单的GCN模型的Python代码示例: ```python import torch import torch.nn as nn import torch.nn.functional as F class GCN(nn.Module): def __init__(self, input_dim, hidden_dim): super(GCN, self).__init__() self.conv1 = nn.Linear(input_dim, hidden_dim) self.conv2 = nn.Linear(hidden_dim, hidden_dim) def forward(self, x, adj): x = F.relu(self.conv1(x)) x = torch.spmm(adj, x) x = F.relu(self.conv2(x)) return x ``` 在这段代码中,定义了一个GCN类,该类继承自`nn.Module`。GCN类包含两个全连接层,分别是`conv1`和`conv2`。在前向传播函数`forward`中,使用了预测矩阵与输入矩阵相乘来计算图卷积。 注意,这仅是一个简单的代码示例,您可以根据您的具体任务对模型进行修改和扩展。

st-gcn python

ST-GCN(Spatial Temporal Graph Convolutional Network)是一种用于动作识别的深度学习模型,可以对连续动作序列进行时间建模和空间特征提取。 ST-GCN模型主要由两个部分组成:空间图卷积和时序卷积。空间图卷积利用空间信息进行特征提取,将骨骼节点的关系建模为图结构,并通过图卷积操作来学习节点之间的空间关系。时序卷积则在时间维度上进行特征提取,对不同时间步的节点特征进行卷积操作。 在Python中,可以使用PyTorch或Tensorflow等深度学习框架实现ST-GCN模型。具体实现时,首先需要构建动作序列的数据集,其中每个动作序列包含一系列骨骼节点的坐标和时间信息。然后,可以使用框架提供的图卷积和卷积操作函数构建ST-GCN模型。 在模型训练过程中,可以使用交叉熵损失函数来度量模型输出和实际标签之间的差异,并使用随机梯度下降等优化算法不断更新模型参数。模型训练完成后,可以使用测试数据集来评估模型在动作分类任务上的性能,例如计算精确度、召回率等指标。 总之,ST-GCN模型是一种用于动作识别的深度学习模型,通过空间图卷积和时序卷积来对骨骼节点的空间和时间特征进行提取,可以使用Python中的深度学习框架实现该模型,并通过训练和测试数据集来评估模型性能。

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高光谱图像分类是遥感图像处理的一个重要分支,在许多领域都有广泛的应用,如农业、林业、环境监测等。GCN(Graph Convolutional Network,图卷积网络)是近年来被广泛应用于图像分类任务的一种神经网络模型,能够有效地提取图像中的特征信息,因此也被用于高光谱图像分类中。 GCN高光谱图像分类代码需要进行以下步骤: 1.准备数据集:从公共数据集中下载高光谱图像数据集,如Indian Pines数据集,包含224x224个像素的224个波段。 2.对原始数据进行预处理:对数据进行标准化处理,将像素值转换为(0,1)之间的范围。 3.构建GCN模型: 使用Python中的keras或tensorflow等深度学习框架,构建GCN模型,包括图结构、卷积层、池化层、激活函数等。 4.训练模型:使用训练集对模型进行训练,并使用交叉验证进行调参,找到最佳的超参数。 5.预测分类:使用测试数据集对模型进行预测,并计算预测结果的准确性和精确度。 GCN高光谱图像分类代码需要注意的点包括: 1.在构建GCN模型时需要使用图结构,并考虑到图的不规则性和稀疏性,适应高光谱图像数据集的特点。 2.在训练模型时需要考虑到过拟合的问题,可以使用dropout等技术来避免。 3.预处理的方法要合适,不同的预处理方法可能会对模型的预测结果产生不同影响。 4.需要选择适当的评估指标,如准确性和精确度等。 总之,GCN高光谱图像分类代码需要深入理解图卷积网络的原理和高光谱图像的特点,充分发挥GCN在图像分类任务中的优势,并在数据预处理、模型构建、训练和预测等方面进行综合考虑才能达到更好的分类结果。
首先,需要明确GCN模型是什么,以及ROC曲线是什么。GCN是一种图神经网络模型,主要用于图数据的分类、回归等任务,而ROC曲线是一种用于评估二分类模型性能的方法,通过绘制真阳性率(True Positive Rate)与假阳性率(False Positive Rate)之间的曲线,来描述分类器在不同阈值下的性能。 接下来,我们来看一下如何基于GCN模型绘制ROC曲线。首先,需要准备用于训练和测试GCN模型的数据集,并将其划分为训练集和测试集。然后,通过基于GCN模型训练出分类器,并在测试集上进行评估,得到分类器在每个阈值下的真阳性率和假阳性率。最后,通过将所有真阳性率和假阳性率绘制在同一张图上,即可得到ROC曲线。 在Python中,可以使用scikit-learn库中的roc_curve函数来计算真阳性率和假阳性率,并使用matplotlib库来绘制ROC曲线。具体的代码实现如下: python import numpy as np import matplotlib.pyplot as plt from sklearn.metrics import roc_curve, auc from gcn_model import GCNModel # 导入GCN模型 # 准备数据集,划分训练集和测试集 x_train, y_train, x_test, y_test = ... # 基于GCN模型训练分类器,对测试集进行评估 model = GCNModel(...) model.fit(x_train, y_train) y_pred = model.predict(x_test) # 计算真阳性率和假阳性率 fpr, tpr, threshold = roc_curve(y_test, y_pred) roc_auc = auc(fpr, tpr) # 绘制ROC曲线 plt.title('Receiver Operating Characteristic') plt.plot(fpr, tpr, 'b', label = 'AUC = %0.2f' % roc_auc) plt.legend(loc = 'lower right') plt.plot([0, 1], [0, 1],'r--') plt.xlim([0, 1]) plt.ylim([0, 1]) plt.ylabel('True Positive Rate') plt.xlabel('False Positive Rate') plt.show() 注意,上面的代码中涉及到了gcn_model模块中的GCNModel类,需要根据实际情况进行替换,以便正确地训练和评估GCN模型。
PyTorch Geometric (PyG)是一个基于PyTorch的几何深度学习扩展库,可以用于图神经网络(Graph Neural Networks,简称GNN)的开发。GCN,即Graph Convolutional Network,是一种常见的GNN模型之一。PyTorch Geometric提供了GCN的实现,可以用于图数据上的节点分类、链接预测等任务。 你可以使用PyG中的GCNConv类来实现GCN模型。首先,你需要定义一个GCN模型类,继承自torch.nn.Module。在该类中,你需要定义GCN的卷积层和一些激活函数等。以下是一个简单的例子: python import torch import torch.nn as nn from torch_geometric.nn import GCNConv class GCN(nn.Module): def __init__(self, input_dim, hidden_dim, output_dim): super(GCN, self).__init__() self.conv1 = GCNConv(input_dim, hidden_dim) self.conv2 = GCNConv(hidden_dim, output_dim) def forward(self, x, edge_index): x = self.conv1(x, edge_index) x = torch.relu(x) x = self.conv2(x, edge_index) return x 在上述代码中,input_dim表示输入特征的维度,hidden_dim表示隐藏层维度,output_dim表示输出维度。forward方法定义了模型的前向传播过程,使用了两个GCN层和ReLU激活函数。 接下来,你可以根据自己的数据构建图,并将其转换为PyG所需的格式。然后,实例化GCN模型并传入图数据进行训练或预测。具体的训练过程可以参考PyTorch官方文档中的教程。 希望这个简单示例能帮到你,如果有更多相关问题,请随时提问!
PyTorch GCN代码是指使用PyTorch库实现图卷积网络(Graph Convolutional Networks,GCN)的代码。 图卷积网络是一种用于图数据的深度学习模型,主要用于节点分类、链接预测和图生成等任务。它通过对图结构进行卷积操作来提取节点的特征表示。而PyTorch是一种基于Python的开源深度学习框架,提供了丰富的神经网络模块和自动求导功能。 在使用PyTorch库实现GCN的代码中,通常需要进行以下几个步骤: 1. 数据准备:需要将图数据转换为PyTorch可处理的数据格式,通常使用邻接矩阵和节点特征矩阵表示图结构和节点特征。 2. 模型定义:定义GCN模型的结构,通常包括多层图卷积层、激活函数和池化层等。每一层的输出作为下一层的输入,以逐层提取节点特征。 3. 模型训练:使用训练数据对定义的GCN模型进行训练,通常使用随机梯度下降(SGD)等优化算法来更新模型参数,以降低训练损失。 4. 模型评估:使用测试数据对训练好的模型进行评估,通常使用准确度、精确度、召回率等指标来评估模型的性能。 需要注意的是,代码的具体实现方式会因不同的GCN变体而有所差异,例如ChebNet、SpectralNet等。此外,代码中还可能包括数据预处理、结果可视化和超参数调优等过程。 总之,PyTorch GCN代码是指使用PyTorch库实现图卷积网络的代码,其实现过程涵盖数据准备、模型定义、模型训练和模型评估等步骤。具体实现方式会因GCN的变体而有所不同。
### 回答1: GCN(Graph Convolutional Network)是一种用于图数据的深度学习模型,广泛应用于社交网络、推荐系统、生物学等领域。而PyTorch是一个基于Python的深度学习框架,提供了高效的自动求导机制和丰富的神经网络模块。 在PyTorch中实现GCN通常包括以下几个步骤: 1. 数据准备:将图数据表示为邻接矩阵和特征矩阵的形式。邻接矩阵描述了图中节点之间的连接关系,特征矩阵则包含了每个节点的特征向量。 2. 定义图卷积层:在PyTorch中,可以通过定义一个继承自nn.Module的新类来实现图卷积层。此类通常包括权重矩阵、激活函数和前向传播函数。权重矩阵用于将当前节点的特征与相邻节点的特征进行线性组合,激活函数则引入非线性变换。 3. 构建GCN模型:利用上述定义的图卷积层构建一个多层的GCN模型。在PyTorch中,可以通过将多个图卷积层串联起来构建一个nn.Sequential模型。 4. 定义损失函数和优化器:根据任务的不同,可以选择适合的损失函数来评估模型的性能,如交叉熵损失函数。同时,需要选择合适的优化器,如Adam优化器,用于更新模型的参数。 5. 训练模型:使用训练数据对模型进行训练。在每个训练迭代中,通过前向传播计算模型的输出,并与真实标签进行比较以计算损失。然后,使用反向传播算法计算梯度,并利用优化器更新模型的参数。 6. 测试模型:使用测试数据对训练好的模型进行测试。通过前向传播计算模型的输出,并与真实标签进行比较以评估模型的性能。 需要注意的是,在实现GCN过程中,还可以对模型进行一些调优,如添加正则化项、使用dropout技术等,以增强模型的泛化能力。此外,还可以使用一些效果更好的GCN变体,如GraphSAGE、GAT等。 综上所述,使用PyTorch实现GCN的过程涉及数据准备、图卷积层定义、GCN模型构建、损失函数和优化器选择、模型训练和测试等环节。掌握了这些步骤后,就可以利用PyTorch实现自己的GCN模型,并在图数据上进行监督学习任务。 ### 回答2: Graph Convolutional Network (GCN) 是一种用于图数据的深度学习模型,它在节点级别上进行特征表示学习和预测。下面是对GCN代码在PyTorch中的讲解。 GCN代码的主要结构如下: 1. 定义图结构:首先,需要定义节点之间的图结构。常见的方式是使用邻接矩阵来表示图中的连接关系。 2. 定义图卷积层:GCN的核心是图卷积层,它采用邻居节点的特征来更新目标节点的特征。在PyTorch中,可以使用torch.nn模块中的GraphConvolution类来实现。 - 在GraphConvolution类中,首先需要定义输入特征的维度和输出特征的维度。 - 在forward方法中,通过邻接矩阵和输入特征,计算每个节点的邻居节点的加权和。 - 然后,通过激活函数(如ReLU)进行非线性变换,得到更新后的特征表示。 - 最后,返回更新后的节点特征。 3. 定义整个GCN模型:GCN模型由多个图卷积层组成。在PyTorch中,可以通过定义一个包含多个图卷积层的类来实现。 - 在类的初始化方法中,定义每一层的输入特征维度、输出特征维度以及层数。 - 在forward方法中,将输入特征作为第一层的输入,并通过多个图卷积层进行特征的传递和更新。 - 返回最后一层的节点特征表示。 4. 数据准备和训练:在训练GCN模型之前,需要准备好带标签的图数据集。可以使用常见的数据处理库(如DGL、NetworkX等)来加载和处理图数据。然后,使用PyTorch的数据加载工具(如DataLoader)将数据转换为可供GCN模型使用的格式。 5. 定义损失函数和优化器:根据具体的问题,选择适合的损失函数和优化器。常见的损失函数包括交叉熵损失函数(CrossEntropyLoss),均方误差损失函数(MSELoss)等。优化器一般选择Adam、SGD等。 6. 模型训练和验证:使用准备好的训练数据和测试数据,对GCN模型进行训练和验证。通过计算损失函数进行参数更新,并根据验证结果确定模型的优化方向。 以上就是对GCN代码在PyTorch中的基本讲解。通过构建图结构、定义图卷积层和整个GCN模型,准备数据并进行训练,可以实现对图数据进行特征表示学习和预测的任务。 ### 回答3: GCN(Graph Convolutional Network)是一种用于图结构数据的深度学习模型,旨在解决图结构数据上的节点分类、链接预测等问题。PyTorch是一种广泛使用的深度学习框架,提供了灵活且高效的计算图表示和自动微分功能。 GCN的PyTorch代码讲解可以从以下几个方面展开: 1. 数据准备:首先,需要将图结构数据表示为邻接矩阵或稀疏矩阵的形式,并将其作为PyTorch的Tensor输入。同时,还需准备标签数据作为模型的监督信号。 2. 模型定义:使用PyTorch构建GCN模型,可以继承torch.nn.Module类,并在forward函数中定义模型的前向传播逻辑。在GCN中,通常包括图卷积层和非线性激活函数。可以使用torch.nn模块提供的函数或自定义函数实现这些操作。 3. 图卷积层:GCN的核心是图卷积层,它在前一层节点的特征基础上,通过邻居节点的信息来更新每个节点的特征表示。可以使用torch_geometric等第三方库提供的图卷积层实现,也可以自己编写代码实现。 4. 优化器和损失函数:将模型输出与标签数据进行比较,并定义损失函数衡量模型预测与真实标签之间的差异。可选择常见的损失函数,例如交叉熵损失函数,并使用PyTorch提供的优化器,如随机梯度下降(SGD)或Adam优化器。 5. 训练过程:定义训练过程的具体逻辑,包括正向传播、计算损失、反向传播、更新模型参数等步骤。可以设置训练迭代次数和学习率等超参数,并使用训练集和验证集对模型进行训练和评估。 总之,GCN的PyTorch代码实现主要包括数据准备、模型定义、图卷积层的实现、优化器和损失函数的选择、以及训练过程的编写。深入理解GCN模型的原理和PyTorch的使用,可以更好地理解和运用GCN的PyTorch代码。
DGCNN(Dynamic Graph Convolutional Neural Network)是一种用于图像分类和分割任务的深度学习模型。它是由Maximilian Nickel等人于2018年提出的。 DGCNN使用图卷积神经网络(GCN)来处理图形数据。传统的卷积神经网络(CNN)主要适用于处理规则结构的图像数据,无法直接处理非规则结构的图数据。而GCN具有处理图数据的能力,可以利用图的邻域信息进行特征提取和图结构处理。 DGCNN的主要特点是使用动态图来建模非规则的图形数据。它通过构建一个动态的k最近邻图来捕捉图像的空间特征。然后,通过一系列的图卷积层和max-pooling层对图像的特征进行提取和汇总。最后,通过全连接和softmax层进行分类或分割任务。 在使用Python实现DGCNN时,我们可以使用深度学习框架,如TensorFlow或PyTorch。首先,我们需要定义模型的网络结构,包括图卷积层、max-pooling层和全连接层等。然后,我们可以使用训练数据进行模型的训练和优化。训练过程中,我们可以使用反向传播算法来更新模型的参数,使得模型能够更好地拟合训练数据。最后,我们可以使用测试数据对模型进行评估,并计算准确率或其他评价指标。 总之,DGCNN是一种用于图像分类和分割任务的深度学习模型。它通过动态图建模非规则图像数据,并使用图卷积神经网络对图像特征进行提取和汇总。使用Python实现DGCNN时,我们可以使用深度学习框架来定义网络结构、训练模型和评估模型。
GCN(Graph Convolutional Networks,图卷积网络)是一种用于图像分类、节点分类等图像处理任务的深度学习模型。下面我将介绍如何使用PyTorch实现GCN。 首先,我们需要安装PyTorch和其它必要的库。可以使用以下命令安装: pip install torch torchvision pip install numpy scipy scikit-learn 接下来,我们需要定义一个GCN模型。以下是一个简单的实现: python import torch import torch.nn as nn import torch.nn.functional as F class GCN(nn.Module): def __init__(self, input_dim, hidden_dim, output_dim): super(GCN, self).__init__() self.fc1 = nn.Linear(input_dim, hidden_dim) self.fc2 = nn.Linear(hidden_dim, output_dim) def forward(self, x, adj): x = F.relu(self.fc1(torch.mm(adj, x))) x = self.fc2(torch.mm(adj, x)) return F.log_softmax(x, dim=1) 在上面的代码中,我们定义了一个三层的GCN模型。input_dim是输入特征的维度,hidden_dim是隐藏层的维度,output_dim是输出层的维度。nn.Linear是一个线性层,F.relu是一个激活函数,F.log_softmax是一个softmax函数。 接下来,我们需要定义一个训练函数。以下是一个简单的实现: python def train(model, optimizer, criterion, features, adj, labels, idx_train): model.train() optimizer.zero_grad() output = model(features, adj) loss = criterion(output[idx_train], labels[idx_train]) loss.backward() optimizer.step() return model, optimizer, loss.item() 在上面的代码中,我们定义了一个训练函数。features是输入特征,adj是邻接矩阵,labels是标签,idx_train是训练样本的索引。我们使用model.train()将模型切换到训练模式,然后使用optimizer.zero_grad()将梯度清零,使用model(features, adj)计算输出,使用criterion(output[idx_train], labels[idx_train])计算损失,使用loss.backward()计算梯度,使用optimizer.step()更新参数。 接下来,我们需要定义一个测试函数。以下是一个简单的实现: python def test(model, features, adj, labels, idx_test): model.eval() output = model(features, adj) _, preds = torch.max(output, dim=1) correct = torch.sum(preds[idx_test] == labels[idx_test]) acc = correct.item() / len(idx_test) return acc 在上面的代码中,我们定义了一个测试函数。features是输入特征,adj是邻接矩阵,labels是标签,idx_test是测试样本的索引。我们使用model.eval()将模型切换到测试模式,然后使用model(features, adj)计算输出,使用torch.max计算最大值,使用torch.sum计算正确的预测数量,使用acc = correct.item() / len(idx_test)计算准确率。 以下是一个完整的GCN模型的实现: python import torch import torch.nn as nn import torch.nn.functional as F class GCN(nn.Module): def __init__(self, input_dim, hidden_dim, output_dim): super(GCN, self).__init__() self.fc1 = nn.Linear(input_dim, hidden_dim) self.fc2 = nn.Linear(hidden_dim, output_dim) def forward(self, x, adj): x = F.relu(self.fc1(torch.mm(adj, x))) x = self.fc2(torch.mm(adj, x)) return F.log_softmax(x, dim=1) def train(model, optimizer, criterion, features, adj, labels, idx_train): model.train() optimizer.zero_grad() output = model(features, adj) loss = criterion(output[idx_train], labels[idx_train]) loss.backward() optimizer.step() return model, optimizer, loss.item() def test(model, features, adj, labels, idx_test): model.eval() output = model(features, adj) _, preds = torch.max(output, dim=1) correct = torch.sum(preds[idx_test] == labels[idx_test]) acc = correct.item() / len(idx_test) return acc 接下来,我们需要加载数据。以下是一个简单的实现: python import numpy as np def load_data(): adj = np.array([[0, 1, 1, 0], [1, 0, 1, 0], [1, 1, 0, 1], [0, 0, 1, 0]]) features = np.array([[0, 1, 0], [1, 0, 0], [0, 0, 1], [1, 0, 0]]) labels = np.array([0, 1, 2, 0]) idx_train = np.array([0, 1, 2]) idx_test = np.array([3]) return adj, features, labels, idx_train, idx_test 在上面的代码中,我们定义了一个简单的图。adj是邻接矩阵,features是输入特征,labels是标签,idx_train是训练样本的索引,idx_test是测试样本的索引。 接下来,我们需要训练模型。以下是一个简单的实现: python import torch.optim as optim adj, features, labels, idx_train, idx_test = load_data() model = GCN(input_dim=features.shape[1], hidden_dim=16, output_dim=labels.max()+1) optimizer = optim.Adam(model.parameters(), lr=0.01) criterion = nn.CrossEntropyLoss() for epoch in range(100): model, optimizer, loss = train(model, optimizer, criterion, features, adj, labels, idx_train) acc = test(model, features, adj, labels, idx_test) print('Epoch: {:03d}, Loss: {:.4f}, Acc: {:.4f}'.format(epoch, loss, acc)) 在上面的代码中,我们定义了一个优化器和一个损失函数。然后,我们使用一个循环来训练模型,并使用test函数测试模型。我们使用print函数打印训练和测试的损失和准确率。 以上就是使用PyTorch实现GCN的一些基本步骤。当然,这只是一个简单的实现,实际中还有很多需要改进的地方。希望能对你有所帮助!
图神经网络是一种专门用于处理图数据的深度学习算法。图数据具有节点和边组成的结构,与传统神经网络的输入数据不同。Python是一门开源的编程语言,具有强大的支持和庞大的开发者社区,适合开发图神经网络。 在实现图神经网络的Python程序中,一般需要使用特定的库或框架,如TensorFlow或PyTorch。这些库或框架提供了许多预设的图神经网络模型和函数,可以在不需要手动编写算法的情况下实现图神经网络。例如,可以使用TensorFlow中的GraphSAGE模型来进行节点分类任务。 在编写程序时,需要首先读取并处理图数据。常见的方法是将节点转换为向量表示,以便用于神经网络中的计算。通常需要对节点特征进行嵌入学习,例如使用GloVe或Word2Vec等算法进行句子嵌入,或者使用GCN(Graph Convolutional Network)算法进行节点嵌入。 接着,需要定义模型架构和训练方式。一般来说,图神经网络可以分为基于节点和基于图的两种类型。在基于节点的图神经网络中,主要是对每个节点进行分类或回归,而在基于图的图神经网络中,主要是对整个图进行分类或回归。可以根据具体任务需求选择合适的模型架构。例如,对于社交网络中的节点分类任务,可以使用基于GCN的模型。 最后,需要进行训练和评估。训练是基于给定的训练数据对神经网络进行优化,以提高模型的性能。常用的优化算法包括随机梯度下降(SGD)、Adam等。评估通常通过在测试数据上进行测试,比较模型实际输出和预期输出的差异,并计算模型在各种指标上的表现,如准确率、召回率和F1分数等。 总之,实现图神经网络的Python程序,需要熟悉图数据处理、神经网络模型设计、训练和评估等知识。同时也需要了解相应的库和框架,以及各种算法的优缺点和使用方法。

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