R studio 的DESeqDataSetFromMatrix的countData想输入浮点数，怎么做

DESeq2库的DESeqDataSetFromMatrix函数中countData参数默认接受整数型数据。如果你希望输入浮点数型的countData，可以使用DESeqDataSet函数来创建DESeqDataSet对象，并手动指定countData参数的类型为"numeric"。

以下是一个示例：

library(DESeq2)

# 创建colData对象
colData <- data.frame(
  group = c("A", "A", "B", "B"),
  condition = c("Control", "Control", "Treatment", "Treatment")
)

# 创建DESeqDataSet对象，指定countData类型为"numeric"
dds <- DESeqDataSet(
  counts = ABC_1,  # 浮点数型的countData
  colData = colData,
  design = ~ group
)

这样，你就可以使用浮点数型的countData创建DESeqDataSet对象，然后用于DESeq2的差异表达分析。

请注意，使用浮点数型的countData可能会影响DESeq2的结果，因为DESeq2的模型假设count数据符合负二项分布。如果你的数据确实是浮点数型的，建议根据具体情况选择适当的方法进行差异表达分析。

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