MATLAB实现莫兰指数及SSLB数据分析示例

论文由Moran、Rockova和George在2020年发表，主要探讨了基于生物信息学中的双聚类技术。资源中包含的示例代码能够帮助研究者重现该论文中提到的统计分析结果。 莫兰指数（Moran's I）是空间统计学中一种用于衡量空间自相关的指标，常用于地理信息系统（GIS）和生态学研究中。它能够评价一个属性值在整个空间分布中的聚集程度，莫兰指数值越接近1，表示空间自相关性越强，即相似值倾向于聚集在一起；越接近-1，表示空间自相关性越弱，即相似值倾向于相互远离。 在此资源中，代码示例是基于R语言编写的。R语言是一种用于统计计算和图形表现的编程语言和软件环境，非常适合于处理和分析大规模数据集。资源提到的SSLB方法是一种结合了“尖峰和平板”（spike-and-slab）先验的Lasso回归方法，用于执行双聚类分析。双聚类分析是一种在双向（行和列）上同时进行聚类的方法，可用于识别大规模数据集中的模式。 为了运行这些R代码示例，用户需要在R的图形用户界面（GUI）中执行特定的代码。首先，用户需要安装R语言的开发工具包devtools，然后通过devtools安装SSLB R包。在安装SSLB包之前，还需要安装一系列其他R包，这些包提供了进行模拟和数据分析所需的函数和工具，例如mvtnorm（多元正态分布模拟）、isa2（集成聚类分析）、biclust（双聚类分析）、pals（色彩方案工具）、reshape2（数据重塑）、tidyverse（数据科学工具包集合）、gridExtra（网格布局图形）、clue（聚类分析工具）等。 最后，资源还特别提到，如果用户没有安装BiocManager包，需要首先安装这个包，因为它是Bioconductor（一个开源的、提供生物信息学分析工具和数据资源的项目）的管理器，可能对一些生信相关的包有依赖性。 综上所述，这份资源为研究者提供了一个完备的工具链，使得他们能够在MATLAB环境下通过R语言来执行复杂的统计分析，特别是对于空间统计学和双聚类分析感兴趣的研究者。通过这些示例代码和工具包，研究者可以复现和验证“Spike-and-Slab Lasso Biclustering”这篇论文中的方法和结果。"