Python使用Pydicom处理Dicom文件读写

本文主要介绍了如何使用Python的Pydicom库对Dicom文件进行读取和写入操作，包括处理一些特殊情况，如缺失文件元信息和处理DicomTags。 在医学成像领域，Dicom（Digital Imaging and Communications in Medicine）是一种广泛使用的标准格式，用于存储、打印和传输医学图像。Python的Pydicom库提供了方便的API来处理Dicom文件。首先，我们可以通过`pydicom.dcmread()`函数读取单个Dicom文件。例如： ```python import os import pydicom folder_path = r"D:\Files\Data\Materials" file_name = "PA1_0001.dcm" file_path = os.path.join(folder_path, file_name) ds = pydicom.dcmread(file_path) ``` 这里，`ds`是一个`pydicom.dataset.FileDataset`对象，包含了Dicom文件的所有信息。 然而，在某些情况下，如直接处理医院原始数据时，可能会遇到错误，如`InvalidDicomError`，指出文件缺少DICOM File Meta Information头。为了解决这个问题，可以添加`force=True`参数强制读取： ```python ds = pydicom.dcmread(file_path, force=True) ``` 如果之后遇到`AttributeError`，找不到`TransferSyntaxUID`属性，我们需要手动设置这个属性，以确保数据正确解析。通常，可以使用`ImplicitVRLittleEndian`作为默认的传输语法： ```python ds.file_meta.TransferSyntaxUID = pydicom.uid.ImplicitVRLittleEndian ``` 完成这些步骤后，我们就可以读取和编辑Dicom文件中的数据了。对于Dicom Tags（即元数据），可以通过两种方式访问： 1. 使用Tag的描述： ```python print(ds.PatientID, ds.StudyDate, ds.Modality) ``` 2. 使用`ds.get()`函数，传入Tag的名称或Group和Element编号： ```python print(ds.get('PatientID'), ds.get('StudyDate'), ds.get('Modality')) ``` 此外，还可以对Dicom数据进行各种其他处理，例如修改Tag的值、写入新的数据到文件，或者创建新的Dicom文件等。Pydicom库提供了一整套功能，使得开发者能够方便地进行Dicom数据的分析和处理工作。通过深入学习Pydicom库的API，可以实现更复杂的功能，如图像的解码、重采样、转换等。