Joumal of Computer Applications
计算机应用,
2015
,
35(9):
2486 - 2491 ‘ 2512
ISSN
1001-9081
CODENJYIIDU
2015-09-LO
}叫
J:
Ilwww.joca.cn
文章编号
:1001-9081(2015)09-2486-06
doi: 10.
1I
772/j.
issn. 1001- 908
1.
2015.
09.
2486
基于图形处理器加速的医学图像配准技术进展
查珊珊,王远军,聂生东
(
I~r
每理
E
大学院学影像r.科研究所,仁海
200093)
(
*通信作者电子邮箱对
ussL@
126.
eO
Ill)
摘
要:针对目前医学图像自己准技术无法满足临床实时性需求问题,对基于图形处理器(
GPU)
加速的医学图像
自己准技术进行综述探讨。首先对
GPU
通用计算进行概述,再以医学图像西己准基本框架为主线,对近年来基于
GPU
加
速的医学图像配准技术在国内外发展现状进行深入研究,并针对正电子发射型计算机断层显像(
PET)
和电子计算机
断层扫描(
CT)
数据的非线性配准问题,分别基于中央处理器(
CPU)
和
GPU
平台进行配准实验,通过实验结果的对
比,体现
GPU
加速配准技术的优越性。基于
GPU
加速的自由形交
(FFD)
和归一化互信息
(NMI)
结合的非线性配准方
法国已准后互信息值略低于
CPU
平台的配准结果,但其配准速度是
CPU
平台的
12
倍
U
基于
GPU
加速的自己准算法在保
持自己准精度的基础上,自己准速度都得到了很大的提升。
关键词:医学成像;图像自己准;图形处理器;加速;空间交换
中图分类号
:T
凹
9
1.
41
文献标志码
:A
Development of medical image registration technology using GPU
ZHA
Shanshan
,
WANG
Yuanjun
-,
NIE
Shengdong
(
/nstit
ω
e
of
Medical /maging
Engineeri
咯
Abstract:
The current medical image registration technology could not meet the real-time requirements for clinical
diagnosis and treatmen
t. Graphic Processing Unit (GPU) accelerated medical image registration technology
was
reviewed and
discussed for this problem in this
pape
r.币
le
paper summarized GPU general purpose computation, studied current technology
of medical image registration which based on
GPU
acceleration with the essential framework of medical image registration as
main line
, and implemented Positron Emission computed Tomography
(PET)
and Computed Tomography
(CT)
image
registration experiments respectively on Central Processing Unit (CPU) and GPU computing platforms. The Normalized Mutual
Informa
tÍ
on (NMI) value of GPU accelerated medical image registration based on Free Form Deformation ( FFD) and
NMI
was
slightly smaller than that of CPU method, but the registration efficiency is 12 times than CPU method. Except keeping high
registration accuracy
,
GPU
accelerated medical image registration algorithms also get a lot of ascension in tellliS of registration
speed.
Key
words:
medical imaging; image registration; Graphic Processing Unit
(GPU);
acceleration; spatial transform
医学图像配准是针对不同时间或不同模态的两幅医学图
像,寻找某种空间变换,使两者达到空间位置和解剖结构上的
一致,要求配准后的两幅图像上所有的解剖点或至少是所有
在临床上具有诊断意义的点都达到匹配
[1]
。而医生进行诊
断治疗,需要对医学图像中携带的解剖、生理及病理信息建立
空间和时间关系,这使得图像配准已经成为一项常见的临床
工作流程,广泛应用于病情监测、图像引导介入治疗
[2]
以及
治疗效果评估等方面。
由于诊断需求,病人需要进行多次(不同时间或不同模
态)扫描。不断增加的图像数量以及临床的实时性需求,促
使人们寻求更高效的配准方法。这个需求可以从两方面解
决:一是优化设计配准算法,提高计算效率;二是充分利用图
形处理器
(Graphic
Processing Unit ,
GPU)
的计算能力,将配准
过程中的大计算量步骤移植到
GPU
中进行,达到加速配准进
收稿日期
:2015-04-23;
修回日期
:2015
田
06-0
2
0
程的目的。本文针对后一种配准加速方法,首先对
GPU
通用
计算作基本介绍,再以医学图像配准基本框架为主线,调研近
年基于
GPU
加速的医学图像配准技术的研究进展,讨论并指
出了目前
GPU
加速配准技术的优缺点及研究前景。
1
GPU
通用计算概述
1999
年,英伟达公司
(NVIDIA
corporation)
发布第一款
GPU
,主要由两个模块组成:进行
32
位浮点数运算的顶点处
理器,以及进行定点数运算的像素处理器。此时的
GPU
只能
处理顶点的矩阵变换,进行光照计算,不可编程。受游戏市场
中愈加复杂的图形效果和军事仿真需求牵引,
GPU
性能飞速
提升,顶点和像素处理器的可编程性也日益提高。最初,
GPU
只能通过计算机图形应用程序界面
(Application
Program
Interface
,
API)
进行编程,如:开放图形库
(Open
Graphics
基金项目:国家自然科学基金资助项目
(61201067)
;上海市教委科研创新项目(I3
YZ069)
0
作者简介:查珊珊(1
991
- )
,女,安徽舒城人,硕士研究生,主要研究方向.医学图像配准;
王远军(
1980
…)
,男,山东日
11
自人,副教授,博
才,主要研究方向:生物医学
E
程、医学图像处理与分析;
聂生东
(1962
一)
,男,山东泰安人,教投,阱!一,主要研究方向·医学图像处理与分析、
核磁共振图像/信号处理与分析。