GT Standard Oligo Designer：Matlab App设计GTS寡核苷酸

该软件工具可以直接整合进Matlab环境，允许用户通过图形用户界面（GUI）进行方便快捷的oligo设计工作。以下是该工具的核心功能与操作流程的详细解析。 1. 设计片段相关的寡核苷酸 用户首先需要输入他们想要设计的DNA片段的名称和具体的核苷酸序列。Matlab App中的这一功能要求输入的序列长度至少为35个碱基对（bp）。设计界面中会提供一个按钮“Click to design oligos for FRAGMENT”，用户在输入完序列信息之后点击此按钮，即可启动设计流程。需要注意的是，在输入序列时，用户需要将碱基G（鸟嘌呤）和T（胸腺嘧啶）转换为相应的修饰形式，这是为了确保设计出的oligos符合特定的实验要求或保持化学稳定性。 2. 序列长度对设计结果的影响 在用户输入的DNA片段长度超过91个碱基对时，GT Standard的Oligo Designer会设计出两种类型的oligos：一种是带有或不带有磷酸硫键（PS-bonds）的Foligos，另一种是普通的寡核苷酸。PS-bonds是一种化学修饰，它可以增加oligos的稳定性，常用于分子生物学实验中。而当用户输入的片段长度小于91个碱基对时，软件会额外设计并显示Noligos（非修饰片段寡核苷酸）。这种设计上的区别是为了满足不同长度片段的特殊设计需求。 3. 寡核苷酸信息的导出与使用 设计完成后，用户可以使用“Copy oligo info”按钮将设计好的oligo信息复制到桌面操作系统的剪贴板中。当前版本的软件已经通过测试，兼容Microsoft Windows 10操作系统。复制的信息可以方便地粘贴到Microsoft Excel等电子表格软件中进行进一步的分析和记录。软件会按照IDT（Integrated DNA Technologies）公司的订购系统所要求的格式来排列oligos信息，确保用户能够顺利地将设计成果转化为实验材料的订单。 综上所述，GT Standard的Oligo Designer提供了一个集中的平台，通过直观的用户界面和一系列设计规则，帮助研究人员快速有效地设计出适用于实验需求的寡核苷酸。这款Matlab应用软件不仅简化了设计流程，还提供了便捷的信息导出和格式化功能，极大地提高了设计oligos的效率和准确性。"