CPMD软件安装指导：从下载到编译

CPMD安装指导 CPMD（Car-Parrinello Molecular Dynamics）是一种第一性原理分子动力学软件，用于模拟材料科学、化学、生物学等领域的分子动力学过程。以下是CPMD安装指导的相关知识点： 一、下载CPMD CPMD的下载地址可以从官方网站或其他镜像下载站点获取。当前最新版本为3.13.2，大家可以下载该版本的源码和安装文件。 二、相关配置 在安装CPMD之前，需要配置相关的环境变量。这里使用的配置为： * 操作系统：x86_64 GNU/Linux * 编译器：intel/fce/10.1.008/bin/ifort * MPI库：mpich2/bin/mpif90 * GCC编译器：/usr/bin/gcc * 数学库：intel/mkl/10.0.3.020/lib/em64t 三、安装流程 1. 进入SOURCE目录，找到mkconfig.sh文件，并赋予其可执行权限。 ``` cd CPMD-3.13.2/SOURCE chmod a+x mkconfig.sh ``` 2. 生成Makefile文件。 ``` ./mkconfig.sh LINUX-x86_64-FEDORA-MPI > Makefile ``` 其中，LINUX-x86_64-FEDORA-MPI是针对前述配置所选用的计算平台名称，可以根据实际情况选择适合的计算平台名称。 3. 修改Makefile文件。 需要根据前述配置，做以下修改： * SRC= . * DEST= . * BIN= . * FFLAGS=-c -w90 -w95 -O3 -unroll -pc64 -cm * LFLAGS=-L/opt/intel/mkl/10.0.3.020/lib/em64t -lmkl_intel_lp64 -lmkl_sequential -lmkl_core * CFLAGS=-c -O2 -Wall * CPP=/lib/cpp -P -C -traditional * CPPFLAGS=-D__Linux -D__PGI -DFFT_DEFAULT -DPARALLEL -DMYRINET -DLINUX_IFC * NOOPT_FLAG= * FFLAGS_GROMOS=-Dgood_luck * CC=mpicc * FC=mpif77 * LD=mpif77 * AR=ar 四、编译CPMD 在修改完Makefile文件后，可以使用make命令编译CPMD。 五、结论 本文提供了CPMD安装指导的详细步骤，包括下载CPMD、相关配置、安装流程和编译CPMD等步骤。通过遵循这些步骤，用户可以成功安装CPMD并应用于分子动力学模拟。