R语言在生物信息学中的统计应用入门

《生物信息学中的应用统计学：R语言指南》 本著作由Wim P.Krijnen撰写，出版日期为2009年11月10日，旨在为生物信息学领域的学习者提供一个入门级别的统计学教程。作者强调，通过本书，读者将能够理解并掌握基础统计概念，从而将中学水平的数学知识与专业统计文献连接起来。书中涵盖了如何利用R语言进行数据探索、可视化以及检验生物学假设，这对于理解和实践如《生物信息学案例研究》(Hahne等人，2008)和《使用R和Bioconductor的生物信息学与计算生物学解决方案》(Genteman等人，2005)等高级教材至关重要。 书中的理论知识被保持在最低限度，但通过大量来自生物信息学研究的实际数据示例来充分展示和解释。为了跟随书中的逻辑推理，读者需要具备的基础是高中水平的函数知识。此外，对于基因表达值的理解（例如Pevsner，2003）或一些基本的统计学原理（如Bain & Engelhardt，1992；Ewens & Grant，2005；Rosner，2000；Samuels & Witmer，2003）会有所帮助。学习者通过阅读本书，不仅将掌握统计分析方法，还能学会如何在R环境下操作，这对于处理基因测序数据、转录组分析、序列比对和生物信息学实验设计等方面具有实际价值。 本书结构严谨，从介绍统计的基本概念如概率、分布、假设检验和回归分析开始，然后逐步深入到更复杂的主题，如时间序列分析、聚类和主成分分析等。每个章节都配有实例和R代码，以便读者在实践中学习和巩固知识。此外，书中还介绍了如何使用R包如dplyr、ggplot2和Bioconductor来进行数据处理和图形展示，这些都是现代生物信息学工作中不可或缺的技能。 《生物信息学中的应用统计学：R语言指南》是一本实用且适合初学者的资源，旨在帮助生物信息学专业人士和学生建立起坚实的统计学基础，进而有效地利用R语言工具解决生物数据中的问题，推动科学研究的发展。