MATLAB实现系统聚类分析:从理论到实践

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"这篇文档介绍了系统聚类算法的MATLAB实现,主要关注系统聚类法的基本概念、距离计算方法以及MATLAB中的实现步骤。系统聚类法是一种无监督的分类方法,适用于各种领域的数据分析,如考古学、地质学、气象学等。文中详细阐述了如何基于样品间的距离进行聚类,并探讨了闵可夫斯基距离的不同形式,包括绝对值距离、欧氏距离和切比雪夫距离。此外,还提到了在处理不同量级和单位的指标时的预处理需求。" 系统聚类法是一种多元统计分析技术,用于对没有预设分类的数据集进行分组。它基于样品之间的相似性或距离进行操作,目的是找到内在的结构或者自然的群组。在实际应用中,系统聚类通常用于那些没有先验知识或模式的情况,通过对大量样品的特征进行分析来构建分类。 在系统聚类中,样品之间的距离是关键的度量标准。闵可夫斯基距离提供了一种通用的计算方式,公式为 [pic],其中[pic] 是特征变量的个数,[pic] 和 [pic] 分别代表两个样品,[pic] 是权重参数。当[pic] 为1时,该距离变为曼哈顿距离(绝对值距离);当[pic] 为2时,得到的是欧氏距离;而[pic] 为无穷大时,得到的是切比雪夫距离。这些距离定义考虑了不同特征变量的重要性,特别是在数据尺度不一时。 在MATLAB中实现系统聚类,通常会调用特定的函数,例如`linkage`函数,它可以计算样品之间的相似性矩阵,并生成树状图(dendrogram)。此外,`cluster`函数可以用来切割链接树,从而确定最终的聚类。在使用这些函数前,可能需要对数据进行标准化处理,确保各特征在同一尺度上,以避免某些特征因为较大的数值范围而占据主导地位。 在实际操作中,需要注意的是,距离计算可能会受到观测值数量级和单位的影响。例如,不同特征的数值范围相差悬殊时,直接计算可能会导致某些特征的影响被忽略。因此,在进行聚类分析之前,通常需要对数据进行预处理,如标准化或归一化,确保所有特征对聚类的影响平等。 上机作业部分可能涉及到应用这些理论知识,实际编写MATLAB代码,执行系统聚类并分析结果。这可能包括读取数据、计算距离矩阵、选择合适的链接方法(如单链接、全链接或平均链接)、生成聚类树并进行解释。通过这样的实践,可以加深对系统聚类算法的理解,并掌握其在实际问题中的应用。